RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 REG4Q9BYZ8 158 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 KLHL31Q9H511 634 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 CCDC167Q9P0B6 97 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 GIMAP2Q9UG22 337 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ADAM29Q9UKF5 820 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 A0A0G2JN53 185 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 LOC100653049A0A140TA62 436 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TP53I11O14683 189 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 KRT34O76011 436 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 RCBTB2O95199 551 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 LRATO95237 230 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 PAX1P15863 534 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SDC1P18827 310 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PRPS1L1P21108 318 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 IDUAP35475 653 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ASMTP46597 345 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ACSM2AQ08AH3 577 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 FAM27E3Q08E93 113 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SERTAD2Q14140 314 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM35AQ53FP2 167 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PIGGQ5H8A4 983 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ACSM2BQ68CK6 577 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PGM2L1Q6PCE3 622 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 RINLQ6ZS11 566 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PACS2Q86VP3 889 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 RIMKLAQ8IXN7 391 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SLC15A4Q8N697 577 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ANKRD53Q8N9V6 530 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 OR10G3Q8NGC4 313 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 NUBPLQ8TB37 319 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ZPLD1Q8TCW7 415 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SPDL1Q96EA4 605 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 APIPQ96GX9 242 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 WDYHV1Q96HA8 205 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 MARK4Q96L34 752 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 GAL3ST4Q96RP7 486 aa8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 MS4A8Q9BY19 250 aa8.44□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 SPNS1Q9H2V7 528 aa8.44□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 A8MXE2 369 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 FBP2O00757 339 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SIAH2O43255 324 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ERI3O43414 337 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TBX19O60806 448 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 CTNSO60931 367 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ETHE1O95571 254 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 HPNP05981 417 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PCNAP12004 261 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 POU2F1P14859 743 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 IL12AP29459 219 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 RPL3P39023 403 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 CD79BP40259 229 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 CDK9P50750 372 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 UFM1P61960 85 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 RPS13P62277 151 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 SRYQ05066 204 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 LRRC74AQ0VAA2 488 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 RUNX2Q13950 521 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SGO1Q5FBB7 561 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 NHSL2Q5HYW2 709 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 REP15Q6BDI9 236 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TRIM40Q6P9F5 258 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ENPP6Q6UWR7 440 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 IKBIPQ70UQ0 350 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SLC29A4Q7RTT9 530 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM52Q8NDY8 209 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 C7orf57Q8NEG2 295 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 OR8J2Q8NGG1 315 aa8.43□□□□□ -1.06
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