RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	STX1B	P61266	288 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	HSPB3	Q12988	150 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	DUSP8	Q13202	625 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	OR7G2	Q8NG99	324 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	C10orf82	Q8WW14	230 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	ELP4	Q96EB1	424 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	ZBTB18	Q99592	522 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	CNR1	P21554	472 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	S100A3	P33764	101 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	MC3R	P41968	323 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	RNF4	P78317	190 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	CBX1	P83916	185 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	SQLE	Q14534	574 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	SLC10A1	Q14973	349 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	TMEM107	Q6UX40	140 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	SPATA21	Q7Z572	469 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	OR2L13	Q8N349	312 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	NUBPL	Q8TB37	319 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	ASB15	Q8WXK1	588 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	RASL10B	Q96S79	203 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	OR10A5	Q9H207	317 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	NTM	Q9P121	344 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	ARID1A	O14497	2285 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	FAM234B	A2RU67	622 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	HSPB2	A8KAH6	182 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	UPK1A	O00322	258 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	DVL2	O14641	736 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	SNX3	O60493	162 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	PSMG1	O95456	288 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	C6orf47	O95873	294 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	IL6	P05231	212 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	PGR	P06401	933 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	GPC1	P35052	558 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	EMD	P50402	254 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	HBA1	P69905	142 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	HSPB2	Q16082	182 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	SARAF	Q96BY9	339 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	FAM107B	Q9H098	131 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	MYOT	Q9UBF9	498 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	FOXF2	Q12947	444 aa		12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	RCAN2	Q14206	197 aa		12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		12.55	□□□□□ -0.4
CS-231	ENST00000552222	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		12.55	□□□□□ -0.4

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