RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537686.5

GGA3-201, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 4,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-201ENST00000537686 MMP2P08253 660 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 AHRP35869 848 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ZNF84P51523 738 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PRKCDQ05655 676 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ERV3-1Q14264 604 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CDKN3Q16667 212 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 UGT2A3Q6UWM9 527 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 Q8N402 240 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CASTOR1Q8WTX7 329 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 NXPE3Q969Y0 559 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PINK1Q9BXM7 581 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 MCOLN1Q9GZU1 580 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 FXYD6Q9H0Q3 95 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 VNN3Q9NY84 501 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ZNF69Q9UC07 566 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SH2B3Q9UQQ2 575 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 VDAC3Q9Y277 283 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PRH1P02810 166 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SYPP08247 313 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ARAFP10398 606 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 FUT1P19526 365 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SFTPDP35247 375 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 RPL34P49207 117 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 RIN1Q13671 783 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 FCRLBQ6BAA4 426 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 HORMAD2Q8N7B1 307 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 OR8S1Q8NH09 359 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 RFT1Q96AA3 541 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ASB16Q96NS5 453 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PITX2Q99697 317 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 POT1Q9NUX5 634 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 B4GALT7Q9UBV7 327 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 HSPB11Q9Y547 144 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 RBBP9O75884 186 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 AIFM1O95831 613 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CXCL10P02778 98 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 P04436 131 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 YES1P07947 543 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 OR1D4P47884 311 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 MAZP56270 477 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ACTA2P62736 377 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ACTG2P63267 376 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SHHQ15465 462 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ISL2Q96A47 359 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TBC1D20Q96BZ9 403 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CCDC115Q96NT0 180 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SLC6A17Q9H1V8 727 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ERVK13-1Q9NX77 482 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ZNF224Q9NZL3 707 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 DHDHQ9UQ10 334 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 BAIAP2Q9UQB8 552 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PLATP00750 562 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CR2P20023 1033 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 NUDT1P36639 197 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 RIDAP52758 137 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 YPEL5P62699 121 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CHRNEQ04844 493 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 POU4F2Q12837 409 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 LSAMPQ13449 338 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 TMEM69Q5SWH9 247 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 LYSMD4Q5XG99 296 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SLC25A25Q6KCM7 469 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 LIMS2Q7Z4I7 341 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ZNF619Q8N2I2 560 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 ZNF615Q8N8J6 731 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 OR52R1Q8NGF1 315 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 OR4C15Q8NGM1 316 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 PRRC1Q96M27 445 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 STUB1Q9UNE7 303 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 SRPK3Q9UPE1 567 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CROCCQ5TZA2 2017 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 CIB4A0PJX0 185 aa9.46□□□□□ -0.89
GGA3-201ENST00000537686 FAM183AA6NL82 134 aa9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms