RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 A4GALTQ9NPC4 353 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 SDHAF3Q9NRP4 125 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 CALML5Q9NZT1 146 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 FLRT3Q9NZU0 649 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 NTNG1Q9Y2I2 539 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 WIF1Q9Y5W5 379 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 KALRNO60229 2985 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM247A6NEH6 219 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ADAM10O14672 748 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 AIM2O14862 343 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 SNPHO15079 494 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 KIAA0513O60268 411 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 NR2F1P10589 423 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 DCTP40126 519 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 MLLT10P55197 1068 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 HPCAP84074 193 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 C19orf57Q0VDD7 668 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 KRT72Q14CN4 511 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 MAPK11Q15759 364 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF141Q15928 474 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 SYPL1Q16563 259 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 GPAT3Q53EU6 434 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 FNDC7Q5VTL7 733 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 TIGD3Q6B0B8 471 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 APOOLQ6UXV4 268 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 FRRS1Q6ZNA5 592 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC22A16Q86VW1 577 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ANKFN1Q8N957 763 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF527Q8NB42 609 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC38A5Q8WUX1 472 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 GALNT9Q9HCQ5 603 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ASF1BQ9NVP2 202 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 TAGLN3Q9UI15 199 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 WDR45Q9Y484 360 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 EXPH5Q8NEV8 1989 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 LRRC3CA6NJW4 275 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ACOT7O00154 380 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 SCDO00767 359 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 H6PDO95479 791 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 CHRM4P08173 479 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 NUDT7P0C024 238 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ARAFP10398 606 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 HPGDP15428 266 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF24P17028 368 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 MASP1P48740 699 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 CRISP3P54108 245 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 MTPNP58546 118 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 PPIAP62937 165 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 PLGLB1Q02325 96 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 SELPLGQ14242 412 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 KLHL26Q53HC5 615 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 RNFT1Q5M7Z0 435 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 GCNT6Q5T4J0 391 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 MARCH3Q86UD3 253 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 MISPQ8IVT2 679 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 SIAH3Q8IW03 269 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF619Q8N2I2 560 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 C10orf111Q8N326 155 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 OR1J4Q8NGS1 313 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 NR4A3Q92570 626 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC39A3Q9BRY0 314 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC38A1Q9H2H9 487 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM38AQ9H6F2 299 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 OLAHQ9NV23 265 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 QPCTLQ9NXS2 382 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 MKLN1Q9UL63 735 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 AP3M1Q9Y2T2 418 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 DTNAQ9Y4J8 743 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 NDUFB5O43674 189 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 SCO2O43819 266 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC28A2O43868 658 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 UGT2B17O75795 530 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ANGPTL1O95841 491 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC6A2P23975 617 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 RFC3P40938 356 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 CHRNEQ04844 493 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 RBBP4Q09028 425 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 C17orf67Q0P5P2 114 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 ART3Q13508 389 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 GPR68Q15743 365 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
PACSIN3-210ENST00000533686 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms