RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-222ENST00000533362 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa20.5■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 DHDDSQ86SQ9 333 aa20.5■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 GALNT10Q86SR1 603 aa20.5■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 RAB8BQ92930 207 aa20.5■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 ROPN1LQ96C74 230 aa20.5■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 ZNF350Q9GZX5 532 aa20.5■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 ACKR4Q9NPB9 350 aa20.5■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 CALML5Q9NZT1 146 aa20.5■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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PUF60-222ENST00000533362 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 EML6Q6ZMW3 1958 aa20.5■□□□□ 0.87
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PUF60-222ENST00000533362 WISP1O95388 367 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 ANGPTL1O95841 491 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 IGHG3P01860 377 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 ATP12AP54707 1039 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 GAS1P54826 345 aa20.49■□□□□ 0.87
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PUF60-222ENST00000533362 GTDC1Q4AE62 458 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 GPAT3Q53EU6 434 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 FNDC7Q5VTL7 733 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 OR4K17Q8NGC6 315 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 OR4C3Q8NH37 302 aa20.49■□□□□ 0.87
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PUF60-222ENST00000533362 PTGES2Q9H7Z7 377 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 PLSCR2Q9NRY7 297 aa20.49■□□□□ 0.87
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PUF60-222ENST00000533362 HPNP05981 417 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 RFPL3SP0C7P2 107 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 GNLYP22749 145 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 CASP6P55212 293 aa20.48■□□□□ 0.87
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PUF60-222ENST00000533362 MARCH3Q86UD3 253 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 WDSUB1Q8N9V3 476 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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PUF60-222ENST00000533362 EXO5Q9H790 373 aa20.48■□□□□ 0.87
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PUF60-222ENST00000533362 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa20.48■□□□□ 0.87
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PUF60-222ENST00000533362 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa20.47■□□□□ 0.87
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PUF60-222ENST00000533362 KIAA0513O60268 411 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 TRAPPC6AO75865 159 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 NR2F1P10589 423 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 MSX1P28360 303 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 MVDP53602 400 aa20.47■□□□□ 0.87
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PUF60-222ENST00000533362 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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PUF60-222ENST00000533362 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 ZAR1Q86SH2 424 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 SNX32Q86XE0 403 aa20.47■□□□□ 0.87
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PUF60-222ENST00000533362 OR14I1A6ND48 311 aa20.46■□□□□ 0.87
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PUF60-222ENST00000533362 ABOP16442 354 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 SRD5A2P31213 254 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 CRISP3P54108 245 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 ZNF141Q15928 474 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 AP1ARQ63HQ0 302 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 DLEU7Q6UYE1 221 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 TRILQ7L0X0 811 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 PIGWQ7Z7B1 504 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 ZNF619Q8N2I2 560 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 CGREF1Q99674 301 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 SH3GL1Q99961 368 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 SAP130Q9H0E3 1048 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PUF60-222ENST00000533362 GID8Q9NWU2 228 aa20.46■□□□□ 0.87
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