RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 Q8N976 141 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR52J3Q8NH60 311 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RDH11Q8TC12 318 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LHX4Q969G2 390 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NGBQ9NPG2 151 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GIMAP2Q9UG22 337 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WDR45Q9Y484 360 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PLXNB1O43157 2135 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A087WV48 116 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAGEB16A2A368 324 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C5orf52A6NGY3 159 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 YDJCA8MPS7 323 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 K7EM74 188 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MOSP00540 346 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 THRBP10828 461 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPL29P47914 159 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FOLH1Q04609 750 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GNMTQ14749 295 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM255AQ5JRV8 349 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C19orf35Q6ZS72 473 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARMCX2Q7L311 632 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATP6V0A1Q93050 837 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IDI2Q9BXS1 227 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ITIH6Q6UXX5 1313 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM86B1E9PN63 330 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TXNDC12O95881 172 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ECDO95905 644 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD55P08174 381 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM86B2P0C5J1 330 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TPBGLP0DKB5 382 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MYBL1P10243 752 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CAPN3P20807 821 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COX7A1P24310 79 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C17orf67Q0P5P2 114 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF273Q14593 569 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PSG5Q15238 335 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STK11Q15831 433 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LIPKQ5VXJ0 399 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MZT2BQ6NZ67 158 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PARGQ86W56 976 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KIAA0895Q8NCT3 520 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SYNPRQ8TBG9 265 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM46BQ96A09 425 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SDF4Q9BRK5 362 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TEKT2Q9UIF3 430 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BTNL2Q9UIR0 455 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PASKQ96RG2 1323 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANXA2P2A6NMY6 339 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SH2D1BO14796 132 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DIAPH2O60879 1101 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SNAPINO95295 136 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC4A1P02730 911 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WARSP23381 471 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TGFBR1P36897 503 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EFNB2P52799 333 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARFRP1Q13795 201 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ASRGL1Q7L266 308 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF664Q8N3J9 261 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SELENOMQ8WWX9 145 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM80Q96HE8 168 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KCNA7Q96RP8 456 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 INPP5KQ9BT40 448 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TEKT3Q9BXF9 490 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC26A1Q9H2B4 701 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GNPTGQ9UJJ9 305 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KIF7Q2M1P5 1343 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A1W2PNN7 141 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ENTPD5O75356 428 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDRT1O95170 752 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PGK2P07205 417 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GCKP35557 465 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NMUP48645 174 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BNIP1Q12981 228 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BAMBIQ13145 260 aa-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms