RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	DEFB134	Q4QY38	66 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	SPINK14	Q6IE38	97 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	TTL	Q8NG68	377 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	ASB5	Q8WWX0	329 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	SLCO2A1	Q92959	643 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	LINGO1	Q96FE5	620 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	SNF8	Q96H20	258 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	HES7	Q9BYE0	225 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	CHODL	Q9H9P2	273 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	KLHL1	Q9NR64	748 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	RASSF1	Q9NS23	344 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	ARL15	Q9NXU5	204 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	DPPA5	A6NC42	116 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552		B9A039	149 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	CHST10	O43529	356 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	OR1F1	O43749	312 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	HSD3B1	P14060	373 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	CHRNB4	P30926	498 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	CDKN2D	P55273	166 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	ETFDH	Q16134	617 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	CEP97	Q8IW35	865 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	SPC24	Q8NBT2	197 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	NEIL2	Q969S2	332 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	LRRC39	Q96DD0	335 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	CERS2	Q96G23	380 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	VMP1	Q96GC9	406 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	SMIM10	Q96HG1	83 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	OR4K3	Q96R72	315 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	C19orf84	I3L1E1	186 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	STATH	P02808	62 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	CD1E	P15812	388 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	GNAZ	P19086	355 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	PTGER1	P34995	402 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	SSR4	P51571	173 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	TLE4	Q04727	773 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PDE4D-222	ENST00000514552	TFF3	Q07654	80 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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