RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507748.1

PHB-208, Transcript of prohibitin, human

TSL 1 (best)

Gene PHB, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHB-208	ENST00000507748	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	SLC43A2	Q8N370	569 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	TTL	Q8NG68	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	ZNF480	Q8WV37	535 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	ISOC1	Q96CN7	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	CA10	Q9NS85	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	NTM	Q9P121	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	GLS2	Q9UI32	602 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	ZNF487	B1APH4	448 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748		H3BML4	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	LYZL6	O75951	148 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	PRKD3	O94806	890 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	WNT11	O96014	354 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	CRYAA	P02489	173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	ZNF17	P17021	662 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	ME2	P23368	584 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	GSTM2	P28161	218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	GALNS	P34059	522 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	RAD52	P43351	418 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	TTPA	P49638	278 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	TGFBR3	Q03167	851 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	CHRNE	Q04844	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	CCNG2	Q16589	344 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	ODF2	Q5BJF6	829 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	GPR157	Q5UAW9	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	CENPU	Q71F23	418 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	COMTD1	Q86VU5	262 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	FAM47B	Q8NA70	645 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	CFHR4	Q92496	578 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	SMIM10	Q96HG1	83 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	MED12L	Q86YW9	2145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PHB-208	ENST00000507748	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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