RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497327.1

GGPS1-208, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, human

TSL 3

Gene GGPS1, Length 868 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGPS1-208	ENST00000497327	C18orf63	Q68DL7	685 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	GUSBP11	Q6P575	273 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ANKRD46	Q86W74	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	C10orf111	Q8N326	155 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	NATD1	Q8N6N6	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	RNF148	Q8N7C7	305 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ZFP90	Q8TF47	636 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	NCSTN	Q92542	709 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	PMM1	Q92871	262 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF681	Q96N22	645 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	SH3GL1	Q99961	368 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	LYRM4	Q9HD34	91 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	DAPP1	Q9UN19	280 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327		R4GN57	208 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	PI4KA	P42356	2102 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327		A0A1W2PRB8	838 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327		H3BML4	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	PGRMC2	O15173	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	DUX1	O43812	170 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	B4GALT2	O60909	372 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	KRT36	O76013	467 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	PSMG1	O95456	288 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	C6orf47	O95873	294 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	GRP	P07492	148 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	IL1RN	P18510	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	OR4D2	P58180	307 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	MTPN	P58546	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CCL7	P80098	99 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	TNFRSF17	Q02223	184 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	BIRC2	Q13490	618 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	FHL1	Q13642	323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	FAM53B	Q14153	422 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CCDC6	Q16204	474 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	AMZ1	Q400G9	498 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	DEFB134	Q4QY38	66 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	LCN8	Q6JVE9	175 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ABHD13	Q7L211	337 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CA13	Q8N1Q1	262 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	EID2	Q8N6I1	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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