RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496954.2

CLASP2-223, Transcript of cytoplasmic linker associated protein 2, human

TSL 4

Gene CLASP2, Length 685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLASP2-223	ENST00000496954	TRPC1	P48995	793 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	IDH3A	P50213	366 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	NME5	P56597	212 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	ART3	Q13508	389 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	VASN	Q6EMK4	673 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	MIER2	Q8N344	545 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	CDS1	Q92903	461 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	OR52E6	Q96RD3	313 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	MED4	Q9NPJ6	270 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	FREM3	P0C091	2139 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954		A0A1W2PQD3	144 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	SCO2	O43819	266 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	GUSB	P08236	651 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	HPGD	P15428	266 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	MSX1	P28360	303 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	MAGEA8	P43361	318 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	DGKQ	P52824	942 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	AQP5	P55064	265 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	STX1B	P61266	288 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	EIPR1	Q53HC9	387 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	SAXO2	Q658L1	398 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	AAGAB	Q6PD74	315 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	MARCH3	Q86UD3	253 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	ANKRD46	Q86W74	232 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	ZNF527	Q8NB42	609 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	OR4C3	Q8NH37	302 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	FBXO30	Q8TB52	745 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	NEURL3	Q96EH8	262 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	OR7D2	Q96RA2	312 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	TIMP4	Q99727	224 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	EXD2	Q9NVH0	621 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	NCKAP5	O14513	1909 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	FAM234B	A2RU67	622 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	CCDC154	A6NI56	674 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	LINC01387	J3KSC0	135 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	SCD	O00767	359 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	NDUFB5	O43674	189 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	CLDN1	O95832	211 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	ANGPTL1	O95841	491 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	BMP7	P18075	431 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	CHM	P24386	653 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	DPP4	P27487	766 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	DCST2	Q5T1A1	773 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	OR2M3	Q8NG83	312 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	RND1	Q92730	232 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	PANX1	Q96RD7	426 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	DSN1	Q9H410	356 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	RMND5A	Q9H871	391 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	DKKL1	Q9UK85	242 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CLASP2-223	ENST00000496954	CENPE	Q02224	2701 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CLASP2-223	ENST00000496954	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CLASP2-223	ENST00000496954	RFXANK	O14593	260 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CLASP2-223	ENST00000496954	ZIC3	O60481	467 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CLASP2-223	ENST00000496954	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06

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