RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	NDUFS1	P28331	727 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	HOXC13	P31276	330 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	CTNNB1	P35222	781 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	SAXO2	Q658L1	398 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	VIT	Q6UXI7	678 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF527	Q8NB42	609 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	HMGB4	Q8WW32	186 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	PINK1	Q9BXM7	581 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	M6PR	P20645	277 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	S1PR1	P21453	382 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ACTR1B	P42025	376 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ACTR1A	P61163	376 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	PGGHG	Q32M88	737 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	OR6V1	Q8N148	313 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	AKR7A2	O43488	359 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	HRG	P04196	525 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	UGT2B7	P16662	529 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	CBL	P22681	906 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	IL12B	P29460	328 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	AQP2	P41181	271 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	VAMP2	P63027	116 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	MPP7	Q5T2T1	576 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	APOOL	Q6UXV4	268 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	DPH7	Q9BTV6	452 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	RLIM	Q9NVW2	624 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	PPP3CB	P16298	524 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	DLST	P36957	453 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	RGS19	P49795	217 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	SVBP	Q8N300	66 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	C4orf36	Q96KX1	117 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	CMKLR1	Q99788	373 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	SGCE	O43556	437 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	UBL3	O95164	117 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	RAB3D	O95716	219 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	GABRA3	P34903	492 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	TOMM20	Q15388	145 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	MAP6	Q96JE9	813 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	NUP205	Q92621	2012 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574		A8MUA0	341 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	UBB	P0CG47	229 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	GDNF	P39905	211 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	SYPL1	Q16563	259 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF546	Q86UE3	836 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	SMPDL3B	Q92485	455 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	PKMYT1	Q99640	499 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	CSF1	P09603	554 aa		13.33	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	SP3	Q02447	781 aa		13.33	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	TEK	Q02763	1124 aa		13.33	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	BAK1	Q16611	211 aa		13.33	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		13.33	□□□□□ -0.27
PKD1-222	ENST00000496574	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		13.33	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms