RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	SERPIND1	P05546	499 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	RBP1	P09455	135 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	GFAP	P14136	432 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ANPEP	P15144	967 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	CD1D	P15813	335 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ALOX12	P18054	663 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	TFEB	P19484	476 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	CHM	P24386	653 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	GALNS	P34059	522 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	HSPA13	P48723	471 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ACTR3	P61158	418 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	RGS1	Q08116	209 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	CDC20	Q12834	499 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	MED21	Q13503	144 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	NCF4	Q15080	339 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	TGFBI	Q15582	683 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ZIC1	Q15915	447 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	BAK1	Q16611	211 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	PHKG1	Q16816	387 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SBSN	Q6UWP8	590 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ASPG	Q86U10	573 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	PAQR7	Q86WK9	346 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SNX31	Q8N9S9	440 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	TTL	Q8NG68	377 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	EXT2	Q93063	718 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	PTER	Q96BW5	349 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	PYCR2	Q96C36	320 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	WBP1	Q96G27	269 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SH3GL3	Q99963	347 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	MECR	Q9BV79	373 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ACTL8	Q9H568	366 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ALG9	Q9H6U8	611 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	S100A14	Q9HCY8	104 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	STARD5	Q9NSY2	213 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	IL17B	Q9UHF5	180 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	TMCO1	Q9UM00	188 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SDK2	Q58EX2	2172 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SPEG	Q15772	3267 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ACACA	Q13085	2346 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	TRBC2	A0A5B9	178 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	FEZF1	A0PJY2	475 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	HAT1	O14929	419 aa		4.2	□□□□□ -1.74

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