RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492262.1

ZNF638-223, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 2

Gene ZNF638, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-223	ENST00000492262	CUL3	Q13618	768 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	KRT33B	Q14525	404 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	NFATC4	Q14934	902 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	NR1D2	Q14995	579 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	MAPRE2	Q15555	327 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	TGFBI	Q15582	683 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	XKR7	Q5GH72	579 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	LRRC66	Q68CR7	880 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	TTC23L	Q6PF05	361 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC5A8	Q8N695	610 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	ITFG1	Q8TB96	612 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	EXT2	Q93063	718 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	FAM162A	Q96A26	154 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	C19orf60	Q96EN9	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	C3orf30	Q96M34	536 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF382	Q96SR6	550 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	CSF3R	Q99062	836 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF225	Q9UK10	706 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	OARD1	Q9Y530	152 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	REV3L	O60673	3130 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262		A0A087WV48	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	PSMD11	O00231	422 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	UBD	O15205	165 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	RAD51B	O15315	384 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	MID1	O15344	667 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	TAPBP	O15533	448 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	SSX4	O60224	188 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	KRT34	O76011	436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	KRT36	O76013	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	ANP32D	O95626	131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	CA3	P07451	260 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	CTSL	P07711	333 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	LBP	P18428	481 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	TSPAN8	P19075	237 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	GPX3	P22352	226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	GABRA5	P31644	462 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	CDKL1	Q00532	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	E2F5	Q15329	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	PIGG	Q5H8A4	983 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	ING5	Q8WYH8	240 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZNF638-223	ENST00000492262	MR1	Q95460	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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