RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 HIPK1Q86Z02 1210 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 NANPQ8TBE9 248 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF607Q96SK3 696 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 OMDQ99983 421 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 EHFQ9NZC4 300 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 RNF14Q9UBS8 474 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 WDR45Q9Y484 360 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 USP6P35125 1406 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 CLRN2A0PK11 232 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 SPAG6O75602 509 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 PDHBP11177 359 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 CHI3L2Q15782 390 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 CYS1Q717R9 158 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM110Q86TL2 294 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 UNC5CLQ8IV45 518 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 RHOJQ9H4E5 214 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 PAK5Q9P286 719 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 PRODH2Q9UF12 536 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 TBK1Q9UHD2 729 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 ATP10DQ9P241 1426 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 METP08581 1390 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 G3V3Y1 287 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 ZSCAN12O43309 604 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 TM7SF2O76062 418 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 HPP00738 406 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 PIGRP01833 764 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 FAM200BP0CF97 657 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 NT5EP21589 574 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 GLRA2P23416 452 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 SHC1P29353 583 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 RGS4P49798 205 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 PPT1P50897 306 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 RGS1Q08116 209 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 PUDPQ08623 228 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 LTB4RQ15722 352 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 CASC1Q6TDU7 716 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 KDELC1Q6UW63 502 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 UBXN6Q9BZV1 441 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 ARMCX1Q9P291 453 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PNV4 684 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 ESYT2A0FGR8 921 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 GJB5O95377 273 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 IQCF3P0C7M6 154 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 CT45A10P0DMU9 189 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 TBXA2RP21731 343 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 ACVR1BP36896 505 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 OR1D4P47884 311 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 PLA2G16P53816 162 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 GPM6BQ13491 265 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 MESDQ14696 234 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 SLC10A1Q14973 349 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC152Q4G0S7 254 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 TEX44Q53QW1 395 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 OR2T3Q8NH03 318 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 OR2L2Q8NH16 312 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 CUTCQ9NTM9 273 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 SNED1Q8TER0 1413 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-212ENST00000491302 EFCAB7A8K855 629 aa6.01□□□□□ -1.45
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