RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SPRP35270 261 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 BSGP35613 385 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PEX19P40855 299 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SSR2P43308 183 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SEC24CP53992 1094 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC12A2P55011 1212 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PLIN5Q00G26 463 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TNFRSF17Q02223 184 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FUT7Q11130 342 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CUL3Q13618 768 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 HSPB2Q16082 182 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 NHSL2Q5HYW2 709 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 GRTP1Q5TC63 336 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 LIPJQ5W064 366 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM200AQ86VY9 491 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF615Q8N8J6 731 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 L3MBTL4Q8NA19 623 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 OR10G3Q8NGC4 313 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 HUS1BQ8NHY5 278 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 RHEBL1Q8TAI7 183 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 WDR20Q8TBZ3 569 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC22A8Q8TCC7 542 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 DOK4Q8TEW6 326 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM222BQ8WU58 562 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CDKL2Q92772 493 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 UCN3Q969E3 161 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ADIPOR1Q96A54 375 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 NXNL1Q96CM4 212 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ART5Q96L15 291 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 GPR78Q96P69 363 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 KRT12Q99456 494 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ERP44Q9BS26 406 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ANGPTL4Q9BY76 406 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 WWTR1Q9GZV5 400 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ALG9Q9H6U8 611 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CXorf21Q9HAI6 301 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 NMRAL1Q9HBL8 299 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SAYSD1Q9NPB0 183 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TBCCD1Q9NVR7 557 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 GRHL1Q9NZI5 618 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 NUDT4Q9NZJ9 180 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 JKAMPQ9P055 326 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 RNF14Q9UBS8 474 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FETUBQ9UGM5 382 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SPACA6W5XKT8 324 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1W2PS29 197 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 UBXN8O00124 270 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PGRMC2O15173 223 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SNX4O95219 450 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ACSL3O95573 720 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CT62P0C5K7 136 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM58BPP0C7Q3 252 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PCNAP12004 261 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 KLK2P20151 261 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CRABP2P29373 138 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CASP3P42574 277 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PAFAH1B1P43034 410 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CDK9P50750 372 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF136P52737 540 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 RPS13P62277 151 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 HERVK_113P63132 956 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ERVK-8P63133 956 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNJ2P63252 427 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM81Q6P7N7 255 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 MAATS1Q7Z4T9 603 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CMC1Q7Z7K0 106 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CDC20BQ86Y33 519 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 LACC1Q8IV20 430 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TEX9Q8N6V9 391 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 C17orf47Q8NEP4 570 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 TNIP2Q8NFZ5 429 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SPPL2AQ8TCT8 520 aa5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms