RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	CASP3	P42574	277 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	SLC37A1	P57057	533 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	VWA1	Q6PCB0	445 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	UCN2	Q96RP3	112 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	C1orf226	A1L170	272 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	GLOD5	A6NK44	160 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	OR6C76	A6NM76	312 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	PGRMC2	O15173	223 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	NR2F6	P10588	404 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	POU2F1	P14859	743 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	UGT2B10	P36537	528 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	GSTM5	P46439	218 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	KCNJ5	P48544	419 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	C2orf80	Q0P641	193 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	PRR22	Q8IZ63	422 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	STARD4	Q96DR4	205 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	FCRL1	Q96LA6	429 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	C16orf97	H3BN30	126 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	PLOD2	O00469	737 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	WIPF1	O43516	503 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	OR10H2	O60403	315 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	GPR75	O95800	540 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	TGM6	O95932	706 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	CLPS	P04118	112 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	IL3	P08700	152 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	CHM	P24386	653 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	MAPK1	P28482	360 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	ALDH9A1	P49189	494 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	PCYT1A	P49585	367 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	STAR	P49675	285 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	GUCY1A3	Q02108	690 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	EMX2	Q04743	252 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	BIK	Q13323	160 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	SMU1	Q2TAY7	513 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	RIT1	Q92963	219 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	EGLN2	Q96KS0	407 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	SERHL	Q9NQF3	203 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	HEY2	Q9UBP5	337 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	PSME2	Q9UL46	239 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	C2orf72	A6NCS6	295 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	SDHD	O14521	159 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF195	O14628	629 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	PLAU	P00749	431 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	FAM157C	P0CG43	387 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM3-208	ENST00000489344	PRPS2	P11908	318 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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