RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486883.5

ITCH-206, Transcript of itchy E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 2

Gene ITCH, Length 703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITCH-206	ENST00000486883	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	SYCE3	A1L190	88 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	NDUFS4	O43181	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	PROSC	O94903	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	SLC16A8	O95907	504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	CGA	P01215	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	IFNA16	P05015	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	DPP4	P27487	766 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	TTPA	P49638	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	MAP2K6	P52564	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	ARFIP2	P53365	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	NAGLU	P54802	743 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	LINC00205	P59089	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	HILS1	P60008	231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	FUT7	Q11130	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	ASPH	Q12797	758 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	SERTAD2	Q14140	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	E2F2	Q14209	437 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	RCN2	Q14257	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	IQCB1	Q15051	598 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	TOMM20	Q15388	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	NTRK2	Q16620	822 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	SSX8	Q7RTT4	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	HSCB	Q8IWL3	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	NT5C	Q8TCD5	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	P3H4	Q92791	437 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	APOL2	Q9BQE5	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	NTMT1	Q9BV86	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	CAD	P27708	2225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883		A0A088AWK7	358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	IQCF5	A8MTL0	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883		H3BML4	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883		H3BMM5	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883		H7C417	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	PLOD2	O00469	737 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	CLOCK	O15516	846 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	GAS8	O95995	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	CD8A	P01732	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	AHSG	P02765	367 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	COX7A2	P14406	83 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	CTNNA2	P26232	953 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	AHR	P35869	848 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	EFNA4	P52798	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	TAS2R40	P59535	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	DYNLT1	P63172	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	OLR1	P78380	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	LGALS3BP	Q08380	585 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	BIK	Q13323	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	GBX1	Q14549	363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62	7e-9	■□□□□ 9
ITCH-206	ENST00000486883	KRT31	Q15323	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	BCL2A1	Q16548	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	DCST1	Q5T197	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITCH-206	ENST00000486883	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms