RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 GHDCQ8N2G8 530 aa30.01■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 DPP10Q8N608 796 aa30.01■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 ZNF350Q9GZX5 532 aa30.01■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 LIPGQ9Y5X9 500 aa30.01■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa30■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 B4DXG7 233 aa30■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 ALG1L2C9J202 215 aa30■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 CLIC1O00299 241 aa30■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 WISP1O95388 367 aa30■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 GDF1P27539 372 aa30■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 CLK3P49761 638 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 DLEU7Q6UYE1 221 aa30■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 OLIG3Q7RTU3 272 aa30■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 PLCZ1Q86YW0 608 aa30■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 ARMCX1Q9P291 453 aa30■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 CAPN7Q9Y6W3 813 aa30■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa29.99■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 NPIPA7E9PJI5 369 aa29.99■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 NPIPB9F8W1W9 429 aa29.99■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 STX11O75558 287 aa29.99■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 PDE9AO76083 593 aa29.99■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 IGHG3P01860 377 aa29.99■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 NPIPA8P0DM63 369 aa29.99■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 SLC10A1Q14973 349 aa29.99■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 FLYWCH1Q4VC44 716 aa29.99■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 OR5M10Q6IEU7 315 aa29.99■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 ROPN1LQ96C74 230 aa29.99■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa29.99■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 DNAJC13O75165 2243 aa29.99■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 FBP2O00757 339 aa29.98■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 SLC22A2O15244 555 aa29.98■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 FCMRO60667 390 aa29.98■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 CCDC22O60826 627 aa29.98■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 ANGPTL1O95841 491 aa29.98■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 ETFAP13804 333 aa29.98■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 DCTP40126 519 aa29.98■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 CRATP43155 626 aa29.98■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 STX5Q13190 355 aa29.98■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 HOXD1Q9GZZ0 328 aa29.98■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 SDHAF3Q9NRP4 125 aa29.98■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 GMEB1Q9Y692 573 aa29.98■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 RELNP78509 3460 aa29.98■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 GTF3C1Q12789 2109 aa29.98■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 FGD2Q7Z6J4 655 aa29.97■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 DHDDSQ86SQ9 333 aa29.97■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 ACKR4Q9NPB9 350 aa29.97■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 FBXL2Q9UKC9 423 aa29.97■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 PCNX3Q9H6A9 2034 aa29.97■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 POLEQ07864 2286 aa29.97■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 A0A1W2PQD3 144 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 SCDO00767 359 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 ZNHIT1O43257 154 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 CBR3O75828 277 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 GUSBP08236 651 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 HPGDP15428 266 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 ATP12AP54707 1039 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 RGNQ15493 299 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 MAPRE2Q15555 327 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 TRILQ7L0X0 811 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 PIGWQ7Z7B1 504 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 DUSP19Q8WTR2 217 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 RAD21L1Q9H4I0 556 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 MKLN1Q9UL63 735 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 LIPT1Q9Y234 373 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 A0A1B0GTH9 108 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 NDUFB5O43674 189 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 HPNP05981 417 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 DSTNP60981 165 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 GPR68Q15743 365 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 SYPL1Q16563 259 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 GPAT3Q53EU6 434 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 KLHL26Q53HC5 615 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 AP1ARQ63HQ0 302 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 SNX32Q86XE0 403 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 ANKFN1Q8N957 763 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 FADS6Q8N9I5 356 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 GATSQ8NAP1 163 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 SAP130Q9H0E3 1048 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 POLE3Q9NRF9 147 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 WDR45Q9Y484 360 aa29.96■■■□□ 2.39
CHKB-210ENST00000484266 TRAPPC6AO75865 159 aa29.95■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 RBPJQ06330 500 aa29.95■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 C17orf67Q0P5P2 114 aa29.95■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 FADDQ13158 208 aa29.95■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa29.95■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 FRRS1Q6ZNA5 592 aa29.95■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 SPPL2CQ8IUH8 684 aa29.95■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 ZNF527Q8NB42 609 aa29.95■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 OR2M3Q8NG83 312 aa29.95■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 CCDC106Q9BWC9 280 aa29.95■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 SLC6A15Q9H2J7 730 aa29.95■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 IKZF5Q9H5V7 419 aa29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms