RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483984.5

BAP1-208, Transcript of BRCA1 associated protein 1, human

TSL 3

Gene BAP1, Length 699 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BAP1-208	ENST00000483984	CD53	P19397	219 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	ALDH3A1	P30838	453 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	ARRB2	P32121	409 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	DIO3	P55073	304 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	RAET1L	Q5VY80	246 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	MEIOB	Q8N635	442 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	CCDC63	Q8NA47	563 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	NUP43	Q8NFH3	380 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	PGM2	Q96G03	612 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	TRMO	Q9BU70	441 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	RNF122	Q9H9V4	155 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	EQTN	Q9NQ60	294 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	MKS1	Q9NXB0	559 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	KCNK2	O95069	426 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	NGFR	P08138	427 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	BCKDHA	P12694	445 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	CPA2	P48052	419 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	RFX3	P48380	749 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	PRKAG1	P54619	331 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	OCRL	Q01968	901 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	OR2A2	Q6IF42	318 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	GALNT10	Q86SR1	603 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	GGN	Q86UU5	652 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	TRABD2A	Q86V40	505 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	GPR151	Q8TDV0	419 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	NUDT8	Q8WV74	236 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	PPCDC	Q96CD2	204 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	MECR	Q9BV79	373 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	PINK1	Q9BXM7	581 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	EDAR	Q9UNE0	448 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	ZNF175	Q9Y473	711 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	TLDC2	A0PJX2	215 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984		H3BML4	177 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	EMC8	O43402	210 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	NPHS1	O60500	1241 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	DIAPH2	O60879	1101 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	AQP8	O94778	261 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	KCNH1	O95259	989 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	NEFH	P12036	1026 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	TBXA2R	P21731	343 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	HOXC12	P31275	282 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	CD79B	P40259	229 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	POU4F3	Q15319	338 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	DUSP5	Q16690	384 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	SMPDL3B	Q92485	455 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	SLC9A6	Q92581	669 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	MTERF3	Q96E29	417 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BAP1-208	ENST00000483984	ADGRG7	Q96K78	797 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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