RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472561.5

RASSF4-208, Transcript of Ras association domain family member 4, human

TSL 3

Gene RASSF4, Length 892 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RASSF4-208	ENST00000472561	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	FCMR	O60667	390 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	CBR3	O75828	277 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	TRAPPC6A	O75865	159 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	PDE9A	O76083	593 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	ANGPTL1	O95841	491 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	NPIPA8	P0DM63	369 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	ETFA	P13804	333 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	GDF1	P27539	372 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	DCT	P40126	519 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	ATP12A	P54707	1039 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	STX5	Q13190	355 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	TOMM20	Q15388	145 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	RGN	Q15493	299 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	GPR68	Q15743	365 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	SYPL1	Q16563	259 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	APOOL	Q6UXV4	268 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	MKLN1	Q9UL63	735 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	SPTA1	P02549	2419 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	ALG1L2	C9J202	215 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561		J3QKU1	62 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	NDUFB5	O43674	189 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	NGFR	P08138	427 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	NR2F1	P10589	423 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	GNLY	P22749	145 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	DSTN	P60981	165 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	HPCA	P84074	193 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	CHRNE	Q04844	493 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	FUT5	Q11128	374 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	FADD	Q13158	208 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	COQ5	Q5HYK3	327 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	REP15	Q6BDI9	236 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	GHDC	Q8N2G8	530 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	ANKFN1	Q8N957	763 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	ZNF527	Q8NB42	609 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	CGREF1	Q99674	301 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	DSN1	Q9H410	356 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	LDAH	Q9H6V9	325 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	WDR45	Q9Y484	360 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561		A0A1W2PQD3	144 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	TMEM247	A6NEH6	219 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	C17orf51	A8MQB3	221 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	MRAS	O14807	208 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	H6PD	O95479	791 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	FAM107A	O95990	144 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	GUSB	P08236	651 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	CELA3A	P09093	270 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	NUDT7	P0C024	238 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	COX4I1	P13073	169 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	HSF1	Q00613	529 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	TREML1	Q86YW5	311 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	ZNF614	Q8N883	585 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	GATS	Q8NAP1	163 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	UBQLN3	Q9H347	655 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	EXO5	Q9H790	373 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	POLE3	Q9NRF9	147 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	MED11	Q9P086	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	GMEB1	Q9Y692	573 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RASSF4-208	ENST00000472561		A0A1B0GTH9	108 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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