RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 PSKH2Q96QS6 385 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 IWS1Q96ST2 819 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 RIT2Q99578 217 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 VCX2Q9H322 139 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 GNG12Q9UBI6 72 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 NTNG1Q9Y2I2 539 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 GMPPBQ9Y5P6 360 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF487B1APH4 448 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 BTN3A3O00478 584 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 EFNA2O43921 213 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 TPST2O60704 377 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 SNNO75324 88 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 PGCP20142 388 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 ERVK11-1P61568 191 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 PAX8Q06710 450 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 RGS1Q08116 209 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 CD300CQ08708 224 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 MESDQ14696 234 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 ATF7IP2Q5U623 682 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM225Q6GV28 225 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 PMF1Q6P1K2 205 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 STAC2Q6ZMT1 411 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 KIAA1328Q86T90 577 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 IFNEQ86WN2 208 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 BPIFB2Q8N4F0 458 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 CLDN19Q8N6F1 224 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 OR4Q3Q8NH05 313 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC41A3Q96GZ6 507 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 PSMB7Q99436 277 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 DUSP16Q9BY84 665 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 APMAPQ9HDC9 416 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 PIPOXQ9P0Z9 390 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 ASB3Q9Y575 518 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 ARPC3O15145 178 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 SNX4O95219 450 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 MELTFP08582 738 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 HBQ1P09105 142 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF44P15621 663 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 CALB2P22676 271 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 SYPL1Q16563 259 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 ACSM5Q6NUN0 579 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 CYS1Q717R9 158 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRC43Q8N309 656 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 CNIH3Q8TBE1 160 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 M1APQ8TC57 530 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBTB18Q99592 522 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 EDEM2Q9BV94 578 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 ADNPQ9H2P0 1102 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 ELOVL2Q9NXB9 296 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 SENP1Q9P0U3 644 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 RPH3ALQ9UNE2 315 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 METP08581 1390 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A0J9YWU9 116 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRTM2O43300 516 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 SURF6O75683 361 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 RENP00797 406 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 MT3P25713 68 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 GNPDA1P46926 289 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 CSRP3P50461 194 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 AP3M2P53677 418 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 RND3P61587 244 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 IL18R1Q13478 541 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 PEX6Q13608 980 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 ABRAXAS2Q15018 415 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 MICAQ29983 383 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 GFI1BQ5VTD9 330 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 MEDAGQ5VYS4 303 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 REG3GQ6UW15 175 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 METTL7BQ6UX53 244 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 GCNT7Q6ZNI0 430 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 Q6ZTC4 211 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 ACOT1Q86TX2 421 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 STXBP6Q8NFX7 210 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 OR13C2Q8NGS9 318 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-207ENST00000470201 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms