RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 DCTP40126 519 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 GFRA1P56159 465 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 CD226Q15762 336 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF141Q15928 474 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM44Q2T9K0 475 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 KLHL26Q53HC5 615 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 EMC4Q5J8M3 183 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 CCNJQ5T5M9 372 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 MTFR2Q6P444 385 aa7.55□□□□□ -1.2
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TRAPPC3-206ENST00000469757 RNF130Q86XS8 419 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 MSRB3Q8IXL7 192 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 CLEC4FQ8N1N0 589 aa7.55□□□□□ -1.2
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TRAPPC3-206ENST00000469757 CHMP6Q96FZ7 201 aa7.55□□□□□ -1.2
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TRAPPC3-206ENST00000469757 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.55□□□□□ -1.2
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TRAPPC3-206ENST00000469757 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 C17orf51A8MQB3 221 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 E9PLN8 166 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 NR5A2O00482 541 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 SCO2O43819 266 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 STX11O75558 287 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 ANGPTL1O95841 491 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 C1QCP02747 245 aa7.54□□□□□ -1.2
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TRAPPC3-206ENST00000469757 ABOP16442 354 aa7.54□□□□□ -1.2
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TRAPPC3-206ENST00000469757 MATN1P21941 496 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 PTGER4P35408 488 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 ADH7P40394 386 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 ATP12AP54707 1039 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 PER3P56645 1201 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 PLAURQ03405 335 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 C17orf67Q0P5P2 114 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 FADDQ13158 208 aa7.54□□□□□ -1.2
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TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC10A1Q14973 349 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 C3AR1Q16581 482 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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TRAPPC3-206ENST00000469757 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.54□□□□□ -1.2
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TRAPPC3-206ENST00000469757 SSC4DQ8WTU2 575 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 PMM1Q92871 262 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 SARAFQ96BY9 339 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC3-206ENST00000469757 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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