RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	NR4A3	Q92570	626 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	NRBF2	Q96F24	287 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ARHGDIG	Q99819	225 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	NTN4	Q9HB63	628 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1W2PQD3	144 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	CDHR4	A6H8M9	788 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529		H0YJX3	145 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	FMO6P	O60774	539 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	TIPRL	O75663	272 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	BAG2	O95816	211 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	EPPIN	O95925	133 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	IFNW1	P05000	195 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SERPINA7	P05543	415 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	IL7R	P16871	459 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	NRG3	P56975	720 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SOX8	P57073	446 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	VLDLR	P98155	873 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	MAPK14	Q16539	360 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	NRF1	Q16656	503 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	LIN52	Q52LA3	116 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	EIPR1	Q53HC9	387 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	GALNT10	Q86SR1	603 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SMYD1	Q8NB12	490 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	TTC9	Q92623	222 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	NXPE2	Q96DL1	559 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	TPD52L3	Q96J77	140 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	HHATL	Q9HCP6	504 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	PEX12	O00623	359 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	PPM1B	O75688	479 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	DNAJB5	O75953	348 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	CST1	P01037	141 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	OPN1SW	P03999	348 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ABCD3	P28288	659 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	EFR3A	Q14156	821 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	FGFBP1	Q14512	234 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR68	Q15743	365 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	BTBD16	Q32M84	506 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	LYPD8	Q6UX82	237 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ZAR1	Q86SH2	424 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF605	Q86T29	641 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF527	Q8NB42	609 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2T29	Q8NH02	315 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4C3	Q8NH37	302 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	TMBIM1	Q969X1	311 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	DKK4	Q9UBT3	224 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SERINC4	A6NH21	518 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ALG1L2	C9J202	215 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ADAMDEC1	O15204	470 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	FADS1	O60427	444 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	FBXO45	P0C2W1	286 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	DCT	P40126	519 aa		11.73	□□□□□ -0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms