RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF544Q6NX49 715 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 MFSD7Q6UXD7 560 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 C2orf66Q6UXQ4 117 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 GPR142Q7Z601 462 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 LUZP1Q86V48 1076 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 ERO1BQ86YB8 467 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 CRYGNQ8WXF5 182 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM46BQ96A09 425 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 EPSTI1Q96J88 318 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 PAXXQ9BUH6 204 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 TRIM9Q9C026 710 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 IKZF5Q9H5V7 419 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 VPS54Q9P1Q0 977 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 LOC400499M0QZD8 3231 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 TRIOO75962 3097 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A0U1RQK1 487 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF320A2RRD8 509 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 LOC730098B7Z3J9 87 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 MBTPS2O43462 519 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 GJB5O95377 273 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 SBK2P0C263 348 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 UROSP10746 265 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 CD1EP15812 388 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 FERP16591 822 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 ACP1P24666 158 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 ACADSBP45954 432 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 HLCSP50747 726 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF131P52739 623 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 ROR1Q01973 937 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 PPIL2Q13356 520 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC10A1Q14973 349 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 HAGHQ16775 308 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 LCE1CQ5T751 118 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 STEAP1BQ6NZ63 245 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 GCNT7Q6ZNI0 430 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 KCTD9Q7L273 389 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 PRSS48Q7RTY5 328 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 UBQLNLQ8IYU4 475 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 NAT8LQ8N9F0 302 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 FIBINQ8TAL6 211 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 GLYATL1Q969I3 302 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 FUNDC2Q9BWH2 189 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 CNIH4Q9P003 139 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 PRODH2Q9UF12 536 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 CTNNA3Q9UI47 895 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 STX8Q9UNK0 236 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 CFAP46Q8IYW2 2715 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 ABCC4O15439 1325 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 EVC2Q86UK5 1308 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 A8MX80 341 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 I3L1I5 382 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 CHEK1O14757 476 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 STBD1O95210 358 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 SFTPBP07988 381 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 P0C879 139 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 CYP2B6P20813 491 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 UCP1P25874 307 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 MSNP26038 577 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 TKTL1P51854 596 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 NDST1P52848 882 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 GEMP55040 296 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 KRTAP10-1P60331 282 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 TATDN1Q6P1N9 297 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 STOX1Q6ZVD7 989 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 ASRGL1Q7L266 308 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 UBALD2Q8IYN6 164 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 RDH11Q8TC12 318 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 BIRC7Q96CA5 298 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 VSIG2Q96IQ7 327 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 COG3Q96JB2 828 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 MAGEB18Q96M61 343 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM173AQ9BQD7 235 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 FUT8Q9BYC5 575 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 ASB8Q9H765 288 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 ACOXLQ9NUZ1 547 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 DNAJC11Q9NVH1 559 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 ANKMY1Q9P2S6 941 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 ERVK-18Q9QC07 812 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 TRPC4Q9UBN4 977 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 MAD2L2Q9UI95 211 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-206ENST00000467748 EMCNQ9ULC0 261 aa2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms