RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	LINC00471	Q8N535	108 aa		11.38	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	DIO2	Q92813	273 aa		11.38	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		11.38	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	APOL4	Q9BPW4	351 aa		11.38	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	NUDT9	Q9BW91	350 aa		11.38	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	PRR14	Q9BWN1	585 aa		11.38	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		11.38	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		11.38	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		11.38	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		11.38	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		11.38	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	DPPA5	A6NC42	116 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	IDS	B3KWA1	339 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	GDF9	O60383	454 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	ALOX12B	O75342	701 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	CYP7B1	O75881	506 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	OR5F1	O95221	314 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	CCL4	P13236	92 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP6V1B1	P15313	513 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	AGXT	P21549	392 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	ELK4	P28324	431 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	RYK	P34925	604 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	PPIC	P45877	212 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF136	P52737	540 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	NUP107	P57740	925 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	CD47	Q08722	323 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	ST3GAL3	Q11203	375 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	TRAM2	Q15035	370 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	DECR1	Q16698	335 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC157	Q569K6	752 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	PARP8	Q8N3A8	854 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	MORN4	Q8NDC4	146 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		11.37	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435		A6NHS1	94 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	OR6C76	A6NM76	312 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	PRR33	A8MZF0	331 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435		E9PQ18	207 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	MEN1	O00255	615 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	RFPL3	O75679	317 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC34A2	O95436	690 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	GAST	P01350	101 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	GKN3P	P0CG01	181 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	PRG2	P13727	222 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF28	P17035	718 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	HTR2A	P28223	471 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	EPHA2	P29317	976 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	GSS	P48637	474 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP12A	P54707	1039 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	ISL1	P61371	349 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	DCAF7	P61962	342 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	PLAUR	Q03405	335 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	SPEM2	Q0P670	501 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	FGFBP1	Q14512	234 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF141	Q15928	474 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	MEP1A	Q16819	746 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	LCN10	Q6JVE6	187 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC38A4	Q969I6	547 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	PMEPA1	Q969W9	287 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HDLBP-231	ENST00000467435	LMF1	Q96S06	567 aa		11.36	□□□□□ -0.59

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