RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 SOX18P35713 384 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 CA7P43166 264 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 WNT3P56703 355 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 FOXO1Q12778 655 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 RCAN2Q14206 197 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 MAPRE2Q15555 327 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 CD163Q86VB7 1156 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 IFNEQ86WN2 208 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 SIAH3Q8IW03 269 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 PM20D2Q8IYS1 436 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 GATSQ8NAP1 163 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 OR9I1Q8NGQ6 314 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 NEIL3Q8TAT5 605 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 FAM57AQ8TBR7 257 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 RAB8BQ92930 207 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 NEURL3Q96EH8 262 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 SFXN2Q96NB2 322 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 INPP5KQ9BT40 448 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 SLC6A15Q9H2J7 730 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 ACKR4Q9NPB9 350 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 CALML5Q9NZT1 146 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 MED11Q9P086 117 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 TINAGQ9UJW2 476 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 CORO2BQ9UQ03 480 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 CAMK2AQ9UQM7 478 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 NDUFAF1Q9Y375 327 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 WDR45Q9Y484 360 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 GTF3C1Q12789 2109 aa8.74□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 AQP7O14520 342 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 HCRTR2O43614 444 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 CCDC22O60826 627 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 ACTL6AO96019 429 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 CELA3AP09093 270 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 GABRA1P14867 456 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 ME2P23368 584 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 SRD5A2P31213 254 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 DCTP40126 519 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 MAGEA8P43361 318 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 CCR4P51679 360 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 ATP12AP54707 1039 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 PHC1P78364 1004 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 GANABQ14697 944 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 C3AR1Q16581 482 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 GXYLT1Q4G148 440 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 EIPR1Q53HC9 387 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 RAET1LQ5VY80 246 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 C3P1Q6ZMU1 363 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 OR4C3Q8NH37 302 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 STON2Q8WXE9 905 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 ROPN1LQ96C74 230 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 GIMAP5Q96F15 307 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 SDF2Q99470 211 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 ARMC7Q9H6L4 198 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 PROK2Q9HC23 129 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 P2RX2Q9UBL9 471 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 SLC6A5Q9Y345 797 aa8.73□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 MYO7BQ6PIF6 2116 aa8.72□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 A0A087WZY1 265 aa8.72□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 A0A096LPI6 279 aa8.72□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 A0A1W2PP18 115 aa8.72□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.72□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 ALG1L2C9J202 215 aa8.72□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 E9PLN8 166 aa8.72□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 H0Y3Z8 333 aa8.72□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 CLIC1O00299 241 aa8.72□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 ZNHIT1O43257 154 aa8.72□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 FADS1O60427 444 aa8.72□□□□□ -1.01
PKP4-208ENST00000462335 WDR1O75083 606 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms