RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453724.5

RPE-215, Transcript of ribulose-5-phosphate-3-epimerase, humanhuman

TSL 5

Gene RPE, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE-215ENST00000453724 ZNF350Q9GZX5 532 aa5.7□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 OR51I1Q9H343 314 aa5.7□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa5.7□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 TPT1P8Q9HAU6 139 aa5.7□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 ZFP64Q9NPA5 681 aa5.7□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 SLC52A3Q9NQ40 469 aa5.7□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 GID8Q9NWU2 228 aa5.7□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 MAP10Q9P2G4 905 aa5.7□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 POLQO75417 2590 aa5.7□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 PCNX1Q96RV3 2341 aa5.7□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 OR14I1A6ND48 311 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 C9JVG2 144 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 CLIC1O00299 241 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 HMGN4O00479 90 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 SNPHO15079 494 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 KIAA0513O60268 411 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 SUSD5O60279 629 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 HCN1O60741 890 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 ICOSLGO75144 302 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 CBR3O75828 277 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 GLSO94925 669 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 UTS2O95399 124 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 CYP4B1P13584 511 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 MSX1P28360 303 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 DCTP40126 519 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 CDKN2CP42773 168 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 TDGF1P3P51864 188 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 MNAT1P51948 309 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 CRISP3P54108 245 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 DSTNP60981 165 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 C17orf67Q0P5P2 114 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 FOXO1Q12778 655 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 NFYCQ13952 458 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 C4orf17Q53FE4 359 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 FAM91A1Q658Y4 838 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 SLC2A7Q6PXP3 512 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 PIGWQ7Z7B1 504 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 RNF130Q86XS8 419 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 SIAH3Q8IW03 269 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 CMIPQ8IY22 773 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 PRR22Q8IZ63 422 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 GHDCQ8N2G8 530 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 ZNF619Q8N2I2 560 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 OR4N2Q8NGD1 307 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 OR8J3Q8NGG0 315 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 OR5M3Q8NGP4 307 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 OR1J4Q8NGS1 313 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 PIK3R3Q92569 461 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 MIB2Q96AX9 1013 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 C16orf58Q96GQ5 468 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 GPR137Q96N19 417 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 TAAR6Q96RI8 345 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 CCT8L2Q96SF2 557 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 SDF2Q99470 211 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 CGREF1Q99674 301 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 INPP5KQ9BT40 448 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 HES7Q9BYE0 225 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 TTTY12Q9BZ98 90 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 SAP130Q9H0E3 1048 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 TMEM38AQ9H6F2 299 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 ARMC7Q9H6L4 198 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 PTGES2Q9H7Z7 377 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 ACKR4Q9NPB9 350 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 A4GALTQ9NPC4 353 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 DEPPQ9NTK1 212 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 NDE1Q9NXR1 346 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 C15orf41Q9Y2V0 281 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 WDR45Q9Y484 360 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa5.69□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 MED12Q93074 2177 aa5.68□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 A0A087WZY1 265 aa5.68□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 GXYLT2A0PJZ3 443 aa5.68□□□□□ -1.5
RPE-215ENST00000453724 LRRC3CA6NJW4 275 aa5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms