RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXW8Q8N3Y1 598 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 Q8NA96 180 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM110BQ8TC76 370 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 CDS1Q92903 461 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 STMN2Q93045 179 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 HGDQ93099 445 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 ADOQ96SZ5 270 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 G6PC3Q9BUM1 346 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC106Q9BWC9 280 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 HES7Q9BYE0 225 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 OR51I1Q9H343 314 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 RAD21L1Q9H4I0 556 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC6A13Q9NSD5 602 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 EXD2Q9NVH0 621 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 ARMCX1Q9P291 453 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 MAP10Q9P2G4 905 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 SH3GLB1Q9Y371 365 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 GSC2O15499 205 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 UGT2B11O75310 529 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNK2O95069 426 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 RASAL1O95294 804 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 LYNP07948 512 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 CCL3P10147 92 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 PPIBP23284 216 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 CBX3Q13185 183 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 LSAMPQ13449 338 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 KRT72Q14CN4 511 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 CNPY1Q3B7I2 92 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 MMEL1Q495T6 779 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 GTDC1Q4AE62 458 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 ATAD3BQ5T9A4 648 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM81Q6P7N7 255 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 SNX32Q86XE0 403 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF130Q86XS8 419 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 SSC4DQ8WTU2 575 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 SERHL2Q9H4I8 314 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 LUZP4Q9P127 313 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 LOC100653049A0A140TA62 436 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 CLIC1O00299 241 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 PEX1O43933 1283 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 KRT34O76011 436 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 KRT36O76013 467 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 NPPAP01160 153 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 SNTA1Q13424 505 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 LIN52Q52LA3 116 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRK2Q5S007 2527 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 DLEU7Q6UYE1 221 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 RETREG3Q86VR2 466 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 SULF2Q8IWU5 870 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 POGLUT1Q8NBL1 392 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 OR52N2Q8NGI0 321 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 OR5D16Q8NGK9 328 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 XAGE5Q8WWM1 108 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM173AQ9BQD7 235 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 SLAMF8Q9P0V8 285 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNE3Q9Y6H6 103 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 FBP2O00757 339 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 SNX4O95219 450 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 OR12D1P0DN82 309 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 CYP4B1P13584 511 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 RFX3P48380 749 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 CASP9P55211 416 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 NFYCQ13952 458 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 C4orf17Q53FE4 359 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 DCST2Q5T1A1 773 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC30A6Q6NXT4 461 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 FIGNL1Q6PIW4 674 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 DHDDSQ86SQ9 333 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 NSL1Q96IY1 281 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 NODALQ96S42 347 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 ANGPTL4Q9BY76 406 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 METTL7AQ9H8H3 244 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 VAPAQ9P0L0 249 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 CORO2BQ9UQ03 480 aa9.71□□□□□ -0.85
RABGEF1-205ENST00000450873 RELNP78509 3460 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 EVPLLA8MZ36 301 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 MRASO14807 208 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 GYG2O15488 501 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV1D-16P01601 117 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 CRYABP02511 175 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 COX4I1P13073 169 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 PRDX6P30041 224 aa9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms