RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 KLHL21Q9UJP4 597 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 UNC119BA6NIH7 251 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 HCRTR2O43614 444 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 TSPAN15O95858 294 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 FUCA1P04066 466 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 RCAN2Q14206 197 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 TATDN3Q17R31 274 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 CLVS2Q5SYC1 327 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 SCD5Q86SK9 330 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 OR51L1Q8NGJ5 315 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRM-202ENST00000400053 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-202ENST00000400053 BIN3Q9NQY0 253 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRM-202ENST00000400053 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF534Q76KX8 674 aa8.4□□□□□ -1.07
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PTPRM-202ENST00000400053 HIPK2Q9H2X6 1198 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MVB12BQ9H7P6 319 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RDH14Q9HBH5 336 aa8.39□□□□□ -1.07
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