RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 GCGRP47871 477 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 LSSP48449 732 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 SRP9P49458 86 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 SNAP47Q5SQN1 464 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 PDZK1Q5T2W1 519 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 IDNKQ5T6J7 187 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 AGAP6Q5VW22 663 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 ARL9Q6T311 187 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 MTSS1LQ765P7 747 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 YAF2Q8IY57 180 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 GATSQ8NAP1 163 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 OTUB2Q96DC9 234 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 RIPOR3Q96MK2 946 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 AGAP4Q96P64 663 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 KLHL1Q9NR64 748 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 OR6C74A6NCV1 312 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 PROM1O43490 865 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 IDH3BO43837 385 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 UBXN7O94888 489 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 CT62P0C5K7 136 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 ZGLP1P0C6A0 271 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 CPN2P22792 545 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 CXCR2P25025 360 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 KHKP50053 298 aa8.09□□□□□ -1.11
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GINS1-201ENST00000262460 FOXL2P58012 376 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 E2F1Q01094 437 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 SLC48A1Q6P1K1 146 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 C19orf48Q6RUI8 117 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 PRRC1Q96M27 445 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 BCL7BQ9BQE9 202 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 ORAI3Q9BRQ5 295 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 SP140LQ9H930 580 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 CPNE5Q9HCH3 593 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 KCMF1Q9P0J7 381 aa8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
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GINS1-201ENST00000262460 FAM25GB3EWG6 89 aa8.08□□□□□ -1.12
GINS1-201ENST00000262460 AKR7A2O43488 359 aa8.08□□□□□ -1.12
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GINS1-201ENST00000262460 PDE9AO76083 593 aa8.08□□□□□ -1.12
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GINS1-201ENST00000262460 SMSP52788 366 aa8.08□□□□□ -1.12
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GINS1-201ENST00000262460 FBXO42Q6P3S6 717 aa8.08□□□□□ -1.12
GINS1-201ENST00000262460 LYPD8Q6UX82 237 aa8.08□□□□□ -1.12
GINS1-201ENST00000262460 ZNF836Q6ZNA1 936 aa8.08□□□□□ -1.12
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GINS1-201ENST00000262460 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.08□□□□□ -1.12
GINS1-201ENST00000262460 SLC41A3Q96GZ6 507 aa8.08□□□□□ -1.12
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GINS1-201ENST00000262460 WDR45Q9Y484 360 aa8.08□□□□□ -1.12
GINS1-201ENST00000262460 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa8.08□□□□□ -1.12
GINS1-201ENST00000262460 MPDZO75970 2070 aa8.08□□□□□ -1.12
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GINS1-201ENST00000262460 A0A0X1KG70 313 aa8.08□□□□□ -1.12
GINS1-201ENST00000262460 SAGE2PA6NJ88 616 aa8.08□□□□□ -1.12
GINS1-201ENST00000262460 C12orf71A8MTZ7 269 aa8.08□□□□□ -1.12
GINS1-201ENST00000262460 SGK494L7N484 410 aa8.08□□□□□ -1.12
GINS1-201ENST00000262460 PTTG1O95997 202 aa8.08□□□□□ -1.12
GINS1-201ENST00000262460 SAGP10523 405 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
GINS1-201ENST00000262460 ERGP11308 486 aa8.08□□□□□ -1.12
GINS1-201ENST00000262460 PKLRP30613 574 aa8.08□□□□□ -1.12
GINS1-201ENST00000262460 FXYD6P3P58550 94 aa8.08□□□□□ -1.12
GINS1-201ENST00000262460 FRRS1Q6ZNA5 592 aa8.08□□□□□ -1.12
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