RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 SEMA7AO75326 666 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 RNF224P0DH78 156 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 C8orf89P0DMQ9 161 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 MPIP34949 423 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 LIM2P55344 173 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 MFAP5Q13361 173 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 RUNX2Q13950 521 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF750Q32MQ0 723 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 MINDY4Q4G0A6 757 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 KCTD21Q4G0X4 260 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 TTC23Q5W5X9 447 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD34AQ69YU3 496 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 BHLHB9Q6PI77 547 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC116Q8IYX3 515 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 SPPL2AQ8TCT8 520 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 MIPOL1Q8TD10 442 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM19Q96HH6 336 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 EPYCQ99645 322 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 RBCK1Q9BYM8 510 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 FAM192AQ9GZU8 254 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 REEP1Q9H902 201 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 LYRM4Q9HD34 91 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 LANCL2Q9NS86 450 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 MS4A12Q9NXJ0 267 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 PTGFRNQ9P2B2 879 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 DAPP1Q9UN19 280 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 A0A1W2PS29 197 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 PRAMEF25A6NGN4 478 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 C5orf58C9J3I9 102 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 PGM3O95394 542 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 CLIC3O95833 236 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 CLPTM1O96005 669 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 SERPINA7P05543 415 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 TFAP2AP05549 437 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 BCHEP06276 602 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 FHP07954 510 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 ITGAMP11215 1152 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 PRKACGP22612 351 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 ARHGDIAP52565 204 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 OLR1P78380 273 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 FOXB2Q5VYV0 432 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 OFCC1Q8IZS5 231 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 OR56A1Q8NGH5 318 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 RAB8BQ92930 207 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 LMF1Q96S06 567 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF347Q96SE7 839 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 OR51I1Q9H343 314 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 FAM118AQ9NWS6 357 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 PLA2G3Q9NZ20 509 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 NAV2Q8IVL1 2488 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 HS6ST1O60243 411 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 PDE9AO76083 593 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 CPN2P22792 545 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 FEN1P39748 380 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 KHKP50053 298 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 RAD23AP54725 363 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 RHAGQ02094 409 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 LIN52Q52LA3 116 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 MFSD4BQ5TF39 518 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 RNF220Q5VTB9 566 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 KDM4DQ6B0I6 523 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 PEX11GQ96HA9 241 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 P2RX2Q9UBL9 471 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 POLEQ07864 2286 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 ZGRF1Q86YA3 2104 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 ADAMDEC1O15204 470 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 EMC8O43402 210 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 MFN2O95140 757 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 F10P00742 488 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 ITGA2P17301 1181 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 CD247P20963 164 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 MATN1P21941 496 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 RPL5P46777 297 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD37Q7Z713 158 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 TSPAN14Q8NG11 270 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 ELP4Q96EB1 424 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 NTMQ9P121 344 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 ORC6Q9Y5N6 252 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC6-201ENST00000243108 TRIM64CA6NLI5 447 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms