RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 NDC1Q9BTX1 674 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 DUSP23Q9BVJ7 150 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC7A7Q9UM01 511 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 CLDN16Q9Y5I7 305 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 CACNA1EQ15878 2313 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 TP53P04637 393 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 OR1D4P47884 311 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF136P52737 540 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 TSPAN31Q12999 210 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 MFSD4BQ5TF39 518 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 C11orf74Q86VG3 221 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 KMT5CQ86Y97 462 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 GATAD2AQ86YP4 633 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 NKAIN4Q8IVV8 208 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 B3GNT7Q8NFL0 401 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 OR1L3Q8NH93 324 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 TEX47Q8TBZ9 253 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 PTCHD1Q96NR3 888 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 Q9N2J8 555 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 NECTIN3Q9NQS3 549 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 SERTAD3Q9UJW9 196 aa22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A1W2PPW3 197 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 EFCAB10A6NFE3 127 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 GKN3PP0CG01 181 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 ZXDAP98168 799 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 ST3GAL4Q11206 333 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 GINS1Q14691 196 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 PRSS42Q7Z5A4 293 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 IQCF1Q8N6M8 205 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 OR8J1Q8NGP2 316 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 CNIH4Q9P003 139 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 ASXL3Q9C0F0 2248 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 TRAPPC13A5PLN9 417 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 H3BMH7 237 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 LAMTOR5O43504 91 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 FOLR1P15328 257 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 SMSP52788 366 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 ZAR1Q86SH2 424 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC41A2Q96JW4 573 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 OR10A5Q9H207 317 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 TVP23BQ9NYZ1 205 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 SELENONQ9NZV5 590 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 ENPP5Q9UJA9 477 aa22.21■■□□□ 1.15
RPUSD1-201ENST00000007264 STSP08842 583 aa22.2■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 PRG2P13727 222 aa22.2■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 GALNSP34059 522 aa22.2■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 GIPRP48546 466 aa22.2■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 FUT7Q11130 342 aa22.2■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa22.2■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 TCEANCQ8N8B7 351 aa22.2■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 OR4N2Q8NGD1 307 aa22.2■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM255BQ8WV15 326 aa22.2■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 OR1F2PQ96R84 312 aa22.2■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 SEMA5BQ9P283 1151 aa22.2■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 PILRBQ9UKJ0 227 aa22.2■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 DTX4Q9Y2E6 619 aa22.2■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 OR10H1Q9Y4A9 318 aa22.2■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 MMACHCQ9Y4U1 282 aa22.2■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 THY1P04216 161 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 PI4KAP42356 2102 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 OMPP47874 163 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 PDZK1Q5T2W1 519 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 UBE2UQ5VVX9 321 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 NRMQ8IXM6 262 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 C16orf52Q8NHV5 167 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 RNF217Q8TC41 542 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 GAB3Q8WWW8 586 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 NUDT22Q9BRQ3 303 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 G6PC3Q9BUM1 346 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 EVA1AQ9H8M9 152 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 C17orf105B2RV13 164 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 ENTPD6O75354 484 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 LCKP06239 509 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 GUSBP08236 651 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 NFATC3Q12968 1075 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 MINDY4Q4G0A6 757 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 AP1ARQ63HQ0 302 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 PIGKQ92643 395 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 EGLN3Q9H6Z9 239 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 ENAMQ9NRM1 1142 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 LANCL2Q9NS86 450 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 PRODH2Q9UF12 536 aa22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms