RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 PINLYPA6NC86 204 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM200CA6NKL6 621 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 A8MUA0 341 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CLIC1O00299 241 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 MTPNP58546 118 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR85P60893 370 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB8AP61006 207 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 MTX3Q5HYI7 312 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CLECL1Q8IZS7 167 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 LRGUKQ96M69 825 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB126Q9BYW3 111 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PSME2Q9UL46 239 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PR48 441 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM220BPB1ANY3 271 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 TGFBR3LH3BV60 316 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 UMPSP11172 480 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEA8P43361 318 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 NUP107P57740 925 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PLIN5Q00G26 463 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 SELPLGQ14242 412 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 RCN1Q15293 331 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 GTDC1Q4AE62 458 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM211Q6ICI0 200 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2T12Q8NG77 320 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFP90Q8TF47 636 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 RND1Q92730 232 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 TPT1P8Q9HAU6 139 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 NEUROD4Q9HD90 331 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 KCMF1Q9P0J7 381 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CES1P1Q9UKY3 287 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 B3GALT2O43825 422 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE9AO76083 593 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 HBA1P69905 142 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CEBPEQ15744 281 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC48A1Q6P1K1 146 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ERICH5Q6P6B1 374 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CA13Q8N1Q1 262 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 B3GNT7Q8NFL0 401 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4A15Q8NGL6 344 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10A6Q8NH74 314 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CXXC4Q9H2H0 198 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 RAD21L1Q9H4I0 556 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 IKZF5Q9H5V7 419 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ATG4BQ9Y4P1 393 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0G2JMM0 328 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PPB8 328 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PRS3 328 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ELOVL7A1L3X0 281 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 KIR3DP1A8MWS1 328 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ARPC2O15144 300 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PDPK1O15530 556 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGA10O75578 1167 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 GSNP06396 782 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ANPEPP15144 967 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 GGT1P19440 569 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP2R1BP30154 601 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 SKP1P63208 163 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS53Q2L4Q9 553 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PACS2Q86VP3 889 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNJ16Q9NPI9 418 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNN3Q9UGI6 736 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 GMNNO75496 209 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT75O95678 551 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf47O95873 294 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 RNH1P13489 461 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 UQCRC2P22695 453 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CERS1P27544 350 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC7A1P30825 629 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 IST1P53990 364 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PMPCAQ10713 525 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 GLYATQ6IB77 296 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA24Q86W54 205 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 MICU2Q8IYU8 434 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB127Q9H1M4 99 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-216ENST00000628306 DAPP1Q9UN19 280 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms