RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622814.4

IRX4-208, Transcript of iroquois homeobox 4, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene IRX4, Length 2,398 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRX4-208	ENST00000622814	TMCO6	Q96DC7	493 aa		18.92	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		18.92	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	AGAP4	Q96P64	663 aa		18.92	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	OR2M4	Q96R27	311 aa		18.92	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		18.92	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	TMEM129	A0AVI4	362 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	SURF4	O15260	269 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	GSTT2	P0CG29	244 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	GSTT2B	P0CG30	244 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	PBX2	P40425	430 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	GPR68	Q15743	365 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	ASPG	Q86U10	573 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	WDFY2	Q96P53	400 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	TMED9	Q9BVK6	235 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	MMP28	Q9H239	520 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	CTSV	O60911	334 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	NCR1	O76036	304 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	SLC1A3	P43003	542 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	RUNX2	Q13950	521 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	DUSP5	Q16690	384 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	HSDL2	Q6YN16	418 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		18.91	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	SOCS6	O14544	535 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	SLC30A4	O14863	429 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	NPIPA8	P0DM63	369 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	PRG2	P13727	222 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	PRKAR1B	P31321	381 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	TPBG	Q13641	420 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	OR10G6	Q8NH81	332 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	SAMD8	Q96LT4	415 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	CALML5	Q9NZT1	146 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	WDR45	Q9Y484	360 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	FABP12	A6NFH5	140 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	STK25	O00506	426 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	GKN3P	P0CG01	181 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	HOXD12	P35452	270 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	SLC9A3	P48764	834 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	TNFRSF17	Q02223	184 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	RGS1	Q08116	209 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	GPR50	Q13585	617 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	MALT1	Q9UDY8	824 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	KLF15	Q9UIH9	416 aa		18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
IRX4-208	ENST00000622814	SLC35F4	A4IF30	521 aa		18.89	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	SNTN	A6NMZ2	147 aa		18.89	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	DVL2	O14641	736 aa		18.89	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	FPR3	P25089	353 aa		18.89	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	HTR3A	P46098	478 aa		18.89	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	COPZ1	P61923	177 aa		18.89	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	MAPK14	Q16539	360 aa		18.89	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	DECR1	Q16698	335 aa		18.89	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		18.89	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		18.89	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		18.89	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		18.89	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		18.89	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		18.89	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		18.89	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		18.89	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		18.89	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		18.89	■□□□□ 0.61

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