RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622020.4

NPHP4-211, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NPHP4, Length 3,004 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-211ENST00000622020 BTN3A3O00478 584 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 FGF18O76093 207 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 ACRP10323 421 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 CXCL3P19876 107 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 NTSP30990 170 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 TAS2R38P59533 333 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 DSG2Q14126 1118 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 NDUFA9Q16795 377 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 EOGTQ5NDL2 527 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 RNLSQ5VYX0 342 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 MZT2AQ6P582 158 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 DEFB118Q96PH6 123 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 HCAR1Q9BXC0 346 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 OR1A2Q9Y585 309 aa14.76□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 A0A1W2PR48 441 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 CIB4A0PJX0 185 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 PRRT4C9JH25 899 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 PROM1O43490 865 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 GSTM3P21266 225 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 MAPK9P45984 424 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 GCGRP47871 477 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 TGM3Q08188 693 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 CCNJQ5T5M9 372 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 TMEM99Q8N816 258 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF485Q8NCK3 441 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 SOSTQ9BQB4 213 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 SURF4O15260 269 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 GYPBP06028 91 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 PAICSP22234 425 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 CERS1P27544 350 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 KHKP50053 298 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 TSPAN31Q12999 210 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 TNK1Q13470 666 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 AGERQ15109 404 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 POU4F3Q15319 338 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 C16orf62Q7Z3J2 963 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 PIGXQ8TBF5 258 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 OMA1Q96E52 524 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 LRRC3BQ96PB8 259 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 ABHD1Q96SE0 405 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 LIPT1Q9Y234 373 aa14.75□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 THY1P04216 161 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 TALDO1P37837 337 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 OMPP47874 163 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 CCR6P51684 374 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 TRAM2Q15035 370 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 IL17RCQ8NAC3 791 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 OR7D2Q96RA2 312 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 MCHR1Q99705 422 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 KCNJ15Q99712 375 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 DPH1Q9BZG8 443 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 NARFLQ9H6Q4 476 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 CAPN10Q9HC96 672 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 CBLCQ9ULV8 474 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 SPEF1Q9Y4P9 236 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 OBSL1O75147 1896 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 SLC43A1O75387 559 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 GKN3PP0CG01 181 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 CLUP10909 449 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 DRD5P21918 477 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 ENPP1P22413 925 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 RFX3P48380 749 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 NTRK2Q16620 822 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 AADACL4Q5VUY2 407 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 CYB561A3Q8NBI2 242 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 RFT1Q96AA3 541 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa14.74□□□□□ -0.05
NPHP4-211ENST00000622020 SLC7A7Q9UM01 511 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms