RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HYKKA2RU49 373 aa11.01□□□□□ -0.65
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HCRTR1O43613 425 aa11.01□□□□□ -0.65
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CTSBP07858 339 aa11□□□□□ -0.65
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LIMS4P0CW20 117 aa11□□□□□ -0.65
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ENKD1Q9H0I2 346 aa11□□□□□ -0.65
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACTR10Q9NZ32 417 aa11□□□□□ -0.65
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IFNGR2P38484 337 aa10.99□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDH11P55287 796 aa10.99□□□□□ -0.65
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BAK1Q16611 211 aa10.99□□□□□ -0.65
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WDR88Q6ZMY6 472 aa10.99□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q6ZSR6 202 aa10.99□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM69Q86WT6 500 aa10.99□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PEX5LQ8IYB4 626 aa10.99□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa10.99□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMIM10Q96HG1 83 aa10.99□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAMD8Q96LT4 415 aa10.99□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 S1PR5Q9H228 398 aa10.99□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa10.99□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CALML5Q9NZT1 146 aa10.99□□□□□ -0.65
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