RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 OLAHQ9NV23 265 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 CMTM6Q9NX76 183 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 ABI3Q9P2A4 366 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 CTSFQ9UBX1 484 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 SLC7A8Q9UHI5 535 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 U3KQE9 123 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 ACACAQ13085 2346 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 FRG2CA6NGY1 282 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 TO15178 435 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 CREG1O75629 220 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 NKX2-2O95096 273 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 IGKV3-11P04433 115 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 TFPTP0C1Z6 253 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 ITIH1P19827 911 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 SLC7A1P30825 629 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 KDELR2P33947 212 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 GABRA3P34903 492 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 DLSTP36957 453 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 CDKN2CP42773 168 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 CDK9P50750 372 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 ARHGDIAP52565 204 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 BTG2P78543 158 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 CDK5R2Q13319 367 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 GAB1Q13480 694 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 CEACAM7Q14002 265 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 SYT16Q17RD7 645 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 GPAT3Q53EU6 434 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 RABL3Q5HYI8 236 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 FHL5Q5TD97 284 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 OPN5Q6U736 354 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 SPATA24Q86W54 205 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 HPS6Q86YV9 775 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 MISPQ8IVT2 679 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 MSRB3Q8IXL7 192 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF440Q8IYI8 595 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 MMP21Q8N119 569 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 CATSPER1Q8NEC5 780 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 OR7G2Q8NG99 324 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 GPR151Q8TDV0 419 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 SLC9A6Q92581 669 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 PROX1Q92786 737 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 KAT2AQ92830 837 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 OR7D2Q96RA2 312 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF347Q96SE7 839 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 OR8D2Q9GZM6 311 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 VCXQ9H320 206 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 OR51I1Q9H343 314 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 C5AR2Q9P296 337 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 NUP210LQ5VU65 1888 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 SPTBN2O15020 2390 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 SCN2AQ99250 2005 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 DHRS12A0PJE2 317 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 SYT5O00445 386 aa6.78□□□□□ -1.32
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