RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 FADS2O95864 444 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
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CAPNS1-204ENST00000587718 IDH2P48735 452 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
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CAPNS1-204ENST00000587718 DGUOKQ16854 277 aa23.73■■□□□ 1.39
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CAPNS1-204ENST00000587718 FNDC11Q9BVV2 318 aa23.7■■□□□ 1.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 TGFBR2P37173 567 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 IFNGR2P38484 337 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC15A1P46059 708 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 FUT5Q11128 374 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 TGIF1Q15583 401 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 PHF19Q5T6S3 580 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa23.69■■□□□ 1.38
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