RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 IFNKQ9P0W0 207 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 HCN3Q9P1Z3 774 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RNF14Q9UBS8 474 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RWDD2AQ9UIY3 292 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PSG11Q9UQ72 335 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NEU2Q9Y3R4 380 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RPTORQ8N122 1335 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TONSLQ96HA7 1378 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 HFM1A2PYH4 1435 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 AKAP12Q02952 1782 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NRXN1Q9ULB1 1477 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DNMBPQ6XZF7 1577 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NEURL4Q96JN8 1562 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 REREQ9P2R6 1566 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PPC1 479 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PR48 441 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SMCO3A2RU48 225 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 METTL21EPA6NDL7 271 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAM90A18PA6NE21 464 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAM90A16PA6NEW6 464 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DUXAA6NLW8 204 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SIGLEC16A6NMB1 481 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PP2D1A8MPX8 630 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 G3V2T6 193 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MKRN2OSH3BPM6 223 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 M0QYV0 167 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 M0R296 226 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PDHXO00330 501 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GOSR2O14653 212 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ADAM10O14672 748 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SELENOFO60613 162 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PLIN3O60664 434 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 UPK3AO75631 287 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TRMUO75648 421 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SULT1C4O75897 302 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 B3GAT3O94766 335 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 BRI3O95415 125 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CTDNEP1O95476 244 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 H6PDO95479 791 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SERPINA1P01009 418 aa2.84□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 MT-ND1P03886 318 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RPN2P04844 631 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV2-30P06310 120 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CHRNGP07510 517 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAM90A15PP0C7V4 464 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAM90A14PP0C7W9 464 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SMIM10L1P0DMW3 83 aa2.84□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 KLRC1P26715 233 aa2.84□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 SSTR2P30874 369 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PTPN7P35236 360 aa2.84□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 MAGEA12P43365 314 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RPL5P46777 297 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MTNR1AP48039 350 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ACOT2P49753 483 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RPL14P50914 215 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 VAV2P52735 878 aa2.84□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 CDH13P55290 713 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM33P57088 247 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SEC61GP60059 68 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PTENP60484 403 aa2.84□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 HERV-K104P63124 156 aa2.84□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 CNTN2Q02246 1040 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SEMG2Q02383 582 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF91Q05481 1191 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MBTD1Q05BQ5 628 aa2.84□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 FGL1Q08830 312 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RBBP4Q09028 425 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DLG1Q12959 904 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MALLQ13021 153 aa2.84□□□□□ -1.95
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