RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	SYT5	O00445	386 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	DVL2	O14641	736 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	SCO2	O43819	266 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	BMP5	P22003	454 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	CHM	P24386	653 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MAPK1	P28482	360 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	STAR	P49675	285 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	CLDN18	P56856	261 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	AAGAB	Q6PD74	315 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	NUP43	Q8NFH3	380 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	SH3GL2	Q99962	352 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	DSN1	Q9H410	356 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	AKAP6	Q13023	2319 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ESPN	B1AK53	854 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	BIRC5	O15392	142 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ITM2A	O43736	263 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	LAMP1	P11279	417 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF708	P17019	499 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPN3	P20807	821 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	HPCAL1	P37235	193 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MPP2	Q14168	576 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	RCAN2	Q14206	197 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	IL23R	Q5VWK5	629 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	APOOL	Q6UXV4	268 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM110B	Q8TC76	370 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR151	Q8TDV0	419 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	SFXN2	Q96NB2	322 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf50	Q9BV19	199 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	DKKL1	Q9UK85	242 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MPDZ	O75970	2070 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	EMC8	O43402	210 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNH1	O95259	989 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	UTS2	O95399	124 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ACP2	P11117	423 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKAG1	P54619	331 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR5	P85299	388 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ARSK	Q6UWY0	536 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MARCH3	Q86UD3	253 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDT8	Q8WV74	236 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MED11	Q9P086	117 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	HIVEP1	P15822	2718 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	F8	P00451	2351 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR91	A4D1P6	747 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200		H0Y3Z8	333 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	TM9SF1	O15321	606 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINE1	P05121	402 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	RFX3	P48380	749 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ASCL1	P50553	236 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	SRY	Q05066	204 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	BCL2A1	Q16548	175 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP5	Q16690	384 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	COQ8B	Q96D53	544 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ZIM3	Q96PE6	472 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	JKAMP	Q9P055	326 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	19.71	■□□□□ 0.75
PPP4C-205	ENST00000563200	CLCA1	A8K7I4	914 aa		19.7	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	IL18BP	O95998	194 aa		19.7	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBB	P07437	444 aa		19.7	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	NGFR	P08138	427 aa		19.7	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CTSS	P25774	331 aa		19.7	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	C21orf58	P58505	322 aa		19.7	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	STX5	Q13190	355 aa		19.7	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	19.7	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CHI3L2	Q15782	390 aa		19.7	■□□□□ 0.74

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