RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 FAM234BA2RU67 622 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 B2RBV5 119 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 C17orf105B2RV13 164 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SNPHO15079 494 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 DYRK3O43781 588 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SLC22A3O75751 556 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 NPPAP01160 153 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 KRT16P08779 473 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 COX7A2P14406 83 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 AHRP35869 848 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 GSTM5P46439 218 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 MASP1P48740 699 aa8.46□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 HMGCS1Q01581 520 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.46□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 IL23RQ5VWK5 629 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ARHGAP24Q8N264 748 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 C9orf106Q8NAJ2 232 aa8.46□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 SLC2A12Q8TD20 617 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PAQR8Q8TEZ7 354 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SERPINI1Q99574 410 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 EFCAB1Q9HAE3 211 aa8.46□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa8.46□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 NDUFAF1Q9Y375 327 aa8.46□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 H0Y3Z8 333 aa8.45□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 RAP1GDS1P52306 607 aa8.45□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 ADPRMQ3LIE5 342 aa8.45□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 FAM219BQ5XKK7 198 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 VASNQ6EMK4 673 aa8.45□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 CYP20A1Q6UW02 462 aa8.45□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 METTL4Q8N3J2 472 aa8.45□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa8.45□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 BEX2Q9BXY8 128 aa8.45□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa8.45□□□□□ -1.06
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