RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559276.5

USP3-212, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 4

Gene USP3, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-212ENST00000559276 STMN3Q9NZ72 180 aa5.46□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 SEC14L3Q9UDX4 400 aa5.46□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 MKLN1Q9UL63 735 aa5.46□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 MKL2Q9ULH7 1088 aa5.46□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 POLQO75417 2590 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 A0A096LPI6 279 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 A8MVJ9 347 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 NPIPB8E9PQR5 432 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 H0YIG0 161 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 H3BMM5 538 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 SGK494L7N484 410 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 CXCR6O00574 342 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 ADAM10O14672 748 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 SLC19A2O60779 497 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 NEURL1O76050 574 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 MYO1DO94832 1006 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 CCNDBP1O95273 360 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 NSA2O95478 260 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 B3GALT4O96024 378 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 CRYABP02511 175 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 CATP04040 527 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 S100BP04271 92 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 MPC1LP0DKB6 136 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 C8orf89P0DMQ9 161 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 BMP4P12644 408 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 NCK1P16333 377 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 IL7RP16871 459 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 FPR1P21462 350 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 IGFBP5P24593 272 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 MAPK1P28482 360 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 S100A5P33763 92 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 CD96P40200 585 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 BCL6P41182 706 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 KIR3DL1P43629 444 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 FOXA1P55317 472 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 COPZ1P61923 177 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 TBPL1P62380 186 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 CSNK1G2P78368 415 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 ABATP80404 500 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 RHAGQ02094 409 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 ZNF33BQ06732 778 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 KIAA0040Q15053 153 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 TESK1Q15569 626 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 ADPRMQ3LIE5 342 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 ZNF404Q494X3 552 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 ZNF766Q5HY98 468 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 ACER2Q5QJU3 275 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 LRIF1Q5T3J3 769 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 SPINK14Q6IE38 97 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 TRIM46Q7Z4K8 759 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 CALHM3Q86XJ0 350 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 CPNE9Q8IYJ1 553 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 RAB42Q8N4Z0 105 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 KCT2Q8NC54 265 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 OR5T3Q8NGG3 340 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 OR51Q1Q8NH59 317 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 MCFD2Q8NI22 146 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 FAM110BQ8TC76 370 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 MCOLN3Q8TDD5 553 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 ZFP90Q8TF47 636 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 UBTD2Q8WUN7 234 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 PIK3R3Q92569 461 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 HPS1Q92902 700 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 SLC38A4Q969I6 547 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 FAM162AQ96A26 154 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 PYURFQ96I23 114 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 LURAP1Q96LR2 239 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 GPR137Q96N19 417 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 FRMD6Q96NE9 622 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 GPR21Q99679 349 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 CCDC32Q9BV29 185 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 YIPF2Q9BWQ6 316 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 DGCR6LQ9BY27 220 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 ITPAQ9BY32 194 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 RACGAP1Q9H0H5 632 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 ARMC7Q9H6L4 198 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 ANKRD10Q9NXR5 420 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 HCN3Q9P1Z3 774 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 ADGRE2Q9UHX3 823 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 ENOPH1Q9UHY7 261 aa5.45□□□□□ -1.54
USP3-212ENST00000559276 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
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