RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530758.1

BRK1-201, Transcript of BRICK1, SCAR/WAVE actin nucleating complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BRK1, Length 1,233 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1-201ENST00000530758 CYP4B1P13584 511 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 IL12BP29460 328 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 PTGDSP41222 190 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 CASP9P55211 416 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 FUT5Q11128 374 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 NFATC3Q12968 1075 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 MAPK11Q15759 364 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 DESI1Q6ICB0 168 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 SLC30A6Q6NXT4 461 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 SULF2Q8IWU5 870 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 FAM13CQ8NE31 585 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 OR8J3Q8NGG0 315 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 RAB8BQ92930 207 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 RCN3Q96D15 328 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 SH3GL1Q99961 368 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 HES7Q9BYE0 225 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 ZNF350Q9GZX5 532 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 HOXD1Q9GZZ0 328 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 DEPPQ9NTK1 212 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.71□□□□□ -0.05
BRK1-201ENST00000530758 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 PEX1O43933 1283 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 STX11O75558 287 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 SNX4O95219 450 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 ETFAP13804 333 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 TBXA2RP21731 343 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 CRATP43155 626 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 GAS1P54826 345 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 DSTNP60981 165 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 FOXO1Q12778 655 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 FIGNL1Q6PIW4 674 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 C10orf111Q8N326 155 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 POGLUT1Q8NBL1 392 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 GRHL3Q8TE85 626 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 IL1RL2Q9HB29 575 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 UBQLN4Q9NRR5 601 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 TAGLN3Q9UI15 199 aa14.7□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 A0A1W2PQD3 144 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 AIM2O14862 343 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 HS6ST1O60243 411 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 FCMRO60667 390 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 ICOSLGO75144 302 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 UTS2O95399 124 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 SLC6A2P23975 617 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 GZMMP51124 257 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 CCNJQ5T5M9 372 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 ZAR1Q86SH2 424 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 SERPINA11Q86U17 422 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 OR2M7Q8NG81 312 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 OR5M3Q8NGP4 307 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 OR4C3Q8NH37 302 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 KLHL1Q9NR64 748 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 PCNX3Q9H6A9 2034 aa14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 ALG1L2C9J202 215 aa14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 GLSO94925 669 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 RASAL1O95294 804 aa14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 ATP6V1C1P21283 382 aa14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 EVI2BP34910 448 aa14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 MNAT1P51948 309 aa14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 ATP12AP54707 1039 aa14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 SELPLGQ14242 412 aa14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 GNA13Q14344 377 aa14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 ZNF141Q15928 474 aa14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 ADRM1Q16186 407 aa14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 SYPL1Q16563 259 aa14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 GRAMD1BQ3KR37 738 aa14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 KLHL26Q53HC5 615 aa14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 APOOLQ6UXV4 268 aa14.68□□□□□ -0.06
BRK1-201ENST00000530758 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms