RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515711.1

LMNA-224, Transcript of lamin A/C, human

TSL 5

Gene LMNA, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMNA-224	ENST00000515711	RHAG	Q02094	409 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	APOF	Q13790	326 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	ERV3-1	Q14264	604 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	IL11RA	Q14626	422 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	CSRP2	Q16527	193 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	FGD3	Q5JSP0	725 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF786	Q8N393	782 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	SLC35B4	Q969S0	331 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	OR6C1	Q96RD1	312 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	OR10A5	Q9H207	317 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711		A0A087WXM4	84 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711		A6NHS1	94 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	FFAR1	O14842	300 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	TM4SF5	O14894	197 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	FCMR	O60667	390 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	FMO6P	O60774	539 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	SCRG1	O75711	98 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	KCNK2	O95069	426 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	EPPIN	O95925	133 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	ONECUT2	O95948	504 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	CLPTM1	O96005	669 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	CBL	P22681	906 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	SSTR4	P31391	388 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	PIGA	P37287	484 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	IFNGR2	P38484	337 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	PGD	P52209	483 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	UGT2B15	P54855	530 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	TAS2R41	P59536	307 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	GABARAPL2	P60520	117 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	DCAF7	P61962	342 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	PSG6	Q00889	435 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	IL1RL1	Q01638	556 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	OCA2	Q04671	838 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	ST3GAL3	Q11203	375 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	FOXC1	Q12948	553 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	NPRL3	Q12980	569 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	LAPTM4A	Q15012	233 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	TRAM2	Q15035	370 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	GPR68	Q15743	365 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	PHF19	Q5T6S3	580 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	VRK2	Q86Y07	508 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	LACC1	Q8IV20	430 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	SLC5A8	Q8N695	610 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	OR52J3	Q8NH60	311 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	PIK3R3	Q92569	461 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	MUS81	Q96NY9	551 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	FEV	Q99581	238 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	MKLN1	Q9UL63	735 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LMNA-224	ENST00000515711	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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