RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	PDF	Q9HBH1	243 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	MAFF	Q9ULX9	164 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	MEN1	O00255	615 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	WRB	O00258	174 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	AQP9	O43315	295 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	HPGDS	O60760	199 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	PPM1B	O75688	479 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	MAS1	P04201	325 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	HSD11B1	P28845	292 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	PTGS2	P35354	604 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	TRAM1	Q15629	374 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	FAM26D	Q5JW98	314 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	SPERT	Q8NA61	448 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	NAXE	Q8NCW5	288 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	COQ8A	Q8NI60	647 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	PMM1	Q92871	262 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	PRR14	Q9BWN1	585 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	PINK1	Q9BXM7	581 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	OR10A4	Q9H209	315 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	PRODH2	Q9UF12	536 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	HIDE1	A8MVS5	230 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	IDUA	P35475	653 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	GPR143	P51810	404 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	GAB1	Q13480	694 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	USP53	Q70EK8	1073 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM239	Q8WW34	195 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	CDS1	Q92903	461 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	RIT1	Q92963	219 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	CHFR	Q96EP1	664 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC120	Q96HB5	630 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		7.59	□□□□□ -1.19
NEK1-208	ENST00000512193	PVR	P15151	417 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SLC35A2	P78381	396 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	E2F1	Q01094	437 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RAB40B	Q12829	278 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	DUSP7	Q16829	419 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	LAX1	Q8IWV1	398 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TGM7	Q96PF1	710 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RBP7	Q96R05	134 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	GPR174	Q9BXC1	333 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	MRO	Q9BYG7	248 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RLIM	Q9NVW2	624 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	GPR34	Q9UPC5	381 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PRH1	P02810	166 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ITGA5	P08648	1049 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CD3G	P09693	182 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	NPPB	P16860	134 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	EPHA2	P29317	976 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CTXN1	P60606	82 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	THAP6	Q8TBB0	222 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ARL6	Q9H0F7	186 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	OR52D1	Q9H346	318 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		7.58	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2

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