RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 PINLYPA6NC86 204 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 BBIP1A8MTZ0 92 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 KIR3DP1A8MWS1 328 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 UTS2O95399 124 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 HPGDP15428 266 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 TBXA2RP21731 343 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 PTPN6P29350 595 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 TDGF1P3P51864 188 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 RPS26P62854 115 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 RBPJQ06330 500 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 COQ5Q5HYK3 327 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 TIGD3Q6B0B8 471 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF130Q86XS8 419 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 SIAH3Q8IW03 269 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 DPP10Q8N608 796 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 OR5D16Q8NGK9 328 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 OR1J4Q8NGS1 313 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 SEC14L3Q9UDX4 400 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 GMEB1Q9Y692 573 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 CAPN7Q9Y6W3 813 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 J3QKU1 62 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 SNPHO15079 494 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 FADS1O60427 444 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 STX11O75558 287 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 KLF10Q13118 480 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 FADDQ13158 208 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 MISPQ8IVT2 679 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 GHDCQ8N2G8 530 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 OR52N2Q8NGI0 321 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 XAGE5Q8WWM1 108 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 SERHL2Q9H4I8 314 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 SVILO95425 2214 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 NPIPA5E9PKD4 350 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 SCDO00767 359 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 IGKV1D-16P01601 117 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 OR12D1P0DN82 309 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 MST1P26927 711 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 PTGDSP41222 190 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 HPCAP84074 193 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 BICRALQ6AI39 1079 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 SDF2Q99470 211 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 NMUR2Q9GZQ4 415 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 NPIPA1Q9UND3 350 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1W2PQD3 144 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM247A6NEH6 219 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 ANKUB1A6NFN9 424 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 ALG1L2C9J202 215 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 CLIC1O00299 241 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 CBR3O75828 277 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 CBX6O95503 412 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 NPPAP01160 153 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 RFC3P40938 356 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 C17orf67Q0P5P2 114 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 STX5Q13190 355 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 GNA13Q14344 377 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC10A1Q14973 349 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 GRAMD1BQ3KR37 738 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 PAGE3Q5JUK9 113 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 RNFT1Q5M7Z0 435 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 AP1ARQ63HQ0 302 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 DESI1Q6ICB0 168 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM251Q8N6I4 163 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 PMM1Q92871 262 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC6A13Q9NSD5 602 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 C15orf41Q9Y2V0 281 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 NBASA2RRP1 2371 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-212ENST00000508338 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC3CA6NJW4 275 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM166BA8MTA8 275 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 EVPLLA8MZ36 301 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 H3BNH8 94 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 HMGN4O00479 90 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 MMEL1Q495T6 779 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 FLYWCH1Q4VC44 716 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 CCNJQ5T5M9 372 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 GFRALQ6UXV0 394 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 PLCZ1Q86YW0 608 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF350Q9GZX5 532 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 GALNT9Q9HCQ5 603 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 ACKR4Q9NPB9 350 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 CALML5Q9NZT1 146 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 P2RX2Q9UBL9 471 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 KCNE3Q9Y6H6 103 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-212ENST00000508338 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
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