RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 A0A1B0GTH9 108 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 CCDC154A6NI56 674 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 RNF223E7ERA6 249 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 NR5A2O00482 541 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 RFXANKO14593 260 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 SCO2O43819 266 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 FADS1O60427 444 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 SNX4O95219 450 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 UTS2O95399 124 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 NPIPA8P0DM63 369 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 CAPN3P20807 821 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 PTPN6P29350 595 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 EVI2BP34910 448 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.9□□□□□ -1.149e-8■□□□□ 9.8
PKP4-216ENST00000495123 SNTA1Q13424 505 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 RCAN2Q14206 197 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 GRAMD1BQ3KR37 738 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 AGKQ53H12 422 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 PAGE3Q5JUK9 113 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 DCST2Q5T1A1 773 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 APOOLQ6UXV4 268 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 OLIG3Q7RTU3 272 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 GHDCQ8N2G8 530 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 WDSUB1Q8N9V3 476 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 OR4C3Q8NH37 302 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 C10orf82Q8WW14 230 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 GTF2H4Q92759 462 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 RAB8BQ92930 207 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 SPDL1Q96EA4 605 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 NEURL3Q96EH8 262 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 GNRHR2Q96P88 292 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 BTBD2Q9BX70 525 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 UBQLN3Q9H347 655 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 OSGIN2Q9Y236 505 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 WIF1Q9Y5W5 379 aa7.9□□□□□ -1.14
PKP4-216ENST00000495123 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 POM121CA8CG34 1229 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 KRT16P08779 473 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 OR12D1P0DN82 309 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 GDF1P27539 372 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 SEC24CP53992 1094 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 LRRC74AQ0VAA2 488 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 FUT5Q11128 374 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 STX5Q13190 355 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 SLC10A1Q14973 349 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 COX20Q5RI15 118 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 C6orf10Q5SRN2 563 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 TIGD3Q6B0B8 471 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 OR5M10Q6IEU7 315 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 MARCH3Q86UD3 253 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 RNF130Q86XS8 419 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 TRIML2Q8N7C3 387 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 MIPOL1Q8TD10 442 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ZFP90Q8TF47 636 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ITCHQ96J02 903 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 RMND5AQ9H871 391 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 FBXL2Q9UKC9 423 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ABCG2Q9UNQ0 655 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.89□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 NCKAP5O14513 1909 aa7.88□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa7.88□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 DUXAA6NLW8 204 aa7.88□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 HMGN4O00479 90 aa7.88□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 SLC19A2O60779 497 aa7.88□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 SEMA7AO75326 666 aa7.88□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 TRAPPC6AO75865 159 aa7.88□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ANP32DO95626 131 aa7.88□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ANGPTL1O95841 491 aa7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms