RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488612.5

RAD51B-212, Transcript of RAD51 paralog B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD51B, Length 1,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51B-212ENST00000488612 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 CRB2Q5IJ48 1285 aa7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 BORAQ6PGQ7 559 aa7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 ARPINQ7Z6K5 226 aa7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 MICU2Q8IYU8 434 aa7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 CATSPER1Q8NEC5 780 aa7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 SLC39A7Q92504 469 aa7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 AGAP4Q96P64 663 aa7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 SH3GL1Q99961 368 aa7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 KLHDC3Q9BQ90 382 aa7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 WFDC6Q9BQY6 131 aa7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 RAD21L1Q9H4I0 556 aa7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 PRORYQ9H606 182 aa7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 SH2D2AQ9NP31 389 aa7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RAD51B-212ENST00000488612 MPDZO75970 2070 aa7.4□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 DSPPQ9NZW4 1301 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 A0A0G2JMM0 328 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 A0A1W2PPB8 328 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 A0A1W2PRS3 328 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 ELOVL7A1L3X0 281 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 C2orf72A6NCS6 295 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 KIR3DP1A8MWS1 328 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 NPIPB9F8W1W9 429 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 G3V3Y1 287 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 KIAA0513O60268 411 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 TPST1O60507 370 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 UGT2B17O75795 530 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 NEURL1O76050 574 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 PGM3O95394 542 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 UTS2O95399 124 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 EPPINO95925 133 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 ATP6V1B2P21281 511 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 PCGF2P35227 344 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 PGM1P36871 562 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 PTGDSP41222 190 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 ERFP50548 548 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 PNLIPRP2P54317 469 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 POLE2P56282 527 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 NRG3P56975 720 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 DMTNQ08495 405 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 FXNQ16595 210 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 NTRK2Q16620 822 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 COL28A1Q2UY09 1125 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 DNAL1Q4LDG9 190 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 PDZK1Q5T2W1 519 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 ABHD17BQ5VST6 288 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 SPINK14Q6IE38 97 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 REEP3Q6NUK4 255 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 ISLR2Q6UXK2 745 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 VRK2Q86Y07 508 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 TAGAPQ8N103 731 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 FBXW8Q8N3Y1 598 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 TMEM156Q8N614 296 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 FAM13CQ8NE31 585 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 SLC22A8Q8TCC7 542 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 GRHL3Q8TE85 626 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 ASB15Q8WXK1 588 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 FIG4Q92562 907 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 TAMM41Q96BW9 452 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF354BQ96LW1 612 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 PROK2Q9HC23 129 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 DEPPQ9NTK1 212 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 EXD2Q9NVH0 621 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 NDE1Q9NXR1 346 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 SLC7A8Q9UHI5 535 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 WDR45Q9Y484 360 aa7.39□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 OR6C70A6NIJ9 312 aa7.38□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 TTC36A6NLP5 189 aa7.38□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 CXCR6O00574 342 aa7.38□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 ACOT8O14734 319 aa7.38□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 ARPC2O15144 300 aa7.38□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 OIP5O43482 229 aa7.38□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 FADS1O60427 444 aa7.38□□□□□ -1.23
RAD51B-212ENST00000488612 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms