RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 LUZP2Q86TE4 346 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 DDIASQ8IXT1 998 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 GCNT2Q8N0V5 402 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 OR9A2Q8NGT5 310 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R36Q96LQ0 422 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 EBF4Q9BQW3 602 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 SIKE1Q9BRV8 207 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 ACPTQ9BZG2 426 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 OR2B2Q9GZK3 357 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 MEAF6Q9HAF1 191 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 JKAMPQ9P055 326 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CFL2Q9Y281 166 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 A0A0G2JND7 137 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 FRG2CA6NGY1 282 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 TRPC5OSA6NMA1 111 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CLCA1A8K7I4 914 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 H0Y3Z8 333 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 ACOX3O15254 700 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 PCDH7O60245 1069 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 ULK1O75385 1050 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 ACTL6AO96019 429 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CT45A8P0DMV1 189 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CT45A9P0DMV2 189 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 EPXP11678 715 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CPN1P15169 458 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 DNASE1P24855 282 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 EPHA3P29320 983 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 DGKQP52824 942 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 GFRA1P56159 465 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 HMGCS1Q01581 520 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 RCAN2Q14206 197 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 POU4F3Q15319 338 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CT45A2Q5DJT8 189 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 FBXW10Q5XX13 1052 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZSR9 355 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 TRIM46Q7Z4K8 759 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 OR4N2Q8NGD1 307 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 OR2T11Q8NH01 316 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 ZPLD1Q8TCW7 415 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 BCAS4Q8TDM0 211 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 STON2Q8WXE9 905 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 LRRC46Q96FV0 321 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 APIPQ96GX9 242 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 POM121Q96HA1 1249 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 COL21A1Q96P44 957 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 OR52B2Q96RD2 323 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 ADOQ96SZ5 270 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 FAIM2Q9BWQ8 316 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 EBPLQ9BY08 206 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 GIMAP2Q9UG22 337 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 PSME2Q9UL46 239 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CCL27Q9Y4X3 112 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PPR1 153 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 SERTM1A2A2V5 107 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 GOLGA8OA6NCC3 632 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 GOLGA8NF8WBI6 632 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 NDUFAB1O14561 156 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 TO15178 435 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 TSPAN2O60636 221 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 CBR3O75828 277 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 OPRM1P35372 400 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 PEX19P40855 299 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 LHX2P50458 406 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 ARFIP2P53365 341 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 ADAM8P78325 824 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 SNTA1Q13424 505 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP11.45□□□□□ -0.582e-46■□□□□ 9
PRAME-212ENST00000485532 PAMR1Q6UXH9 720 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 IFNEQ86WN2 208 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 PLCZ1Q86YW0 608 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 HOMEZQ8IX15 550 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 OR7G2Q8NG99 324 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 ZNF675Q8TD23 568 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 ACTRT2Q8TDY3 377 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 C16orf78Q8WTQ4 265 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 VSTM2LQ96N03 204 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 BTBD9Q96Q07 612 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 FOLH1BQ9HBA9 442 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 GALNT8Q9NY28 637 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 TAS2R10Q9NYW0 307 aa11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms