RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 ANKRD28O15084 1053 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF806P0C7X5 589 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 BMP8BP34820 402 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 UGT2A3Q6UWM9 527 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 SPATC1Q76KD6 591 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 MFSD2AQ8NA29 543 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 ABHD11Q8NFV4 315 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 OR51Q1Q8NH59 317 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 TBC1D20Q96BZ9 403 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 LRRC61Q9BV99 259 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 S1PR5Q9H228 398 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 EXO5Q9H790 373 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 C14orf119Q9NWQ9 140 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 C2orf42Q9NWW7 574 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 ING4Q9UNL4 249 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 NBASA2RRP1 2371 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1W2PS29 197 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 CASKO14936 926 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 FCMRO60667 390 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 IFNGP01579 166 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 ARAFP10398 606 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 PSKH1P11801 424 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 CRISP1P54107 249 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 NRG3P56975 720 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 ANKDD1AQ495B1 522 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 NHSL2Q5HYW2 709 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 TCTE1Q5JU00 501 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 B3GLCTQ6Y288 498 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF793Q6ZN11 406 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 OAFQ86UD1 273 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 TIGD4Q8IY51 512 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 CYB561A3Q8NBI2 242 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 MS4A4EQ96PG1 132 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 CSF3RQ99062 836 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 BRD7Q9NPI1 651 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 COL4A6Q14031 1691 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 SAGE2PA6NJ88 616 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 A8MVJ9 347 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 PIGAP37287 484 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 RAE1P78406 368 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 BTG2P78543 158 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 FZD2Q14332 565 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 NKG7Q16617 165 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 ODF4Q2M2E3 257 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC48A1Q6P1K1 146 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 OR51G2Q8NGK0 314 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 ELP4Q96EB1 424 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 C19orf43Q9BQ61 176 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 MAGIXQ9H6Y5 334 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM45AQ9NWC5 275 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 COMMD3Q9UBI1 195 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 BAIAP2Q9UQB8 552 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 SCN2AQ99250 2005 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 METTL12A8MUP2 240 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 XKRYO14609 159 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 FGF17O60258 216 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 ALPLP05186 524 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 GCGRP47871 477 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 SMSP52788 366 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 CDH11P55287 796 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 ZP2Q05996 745 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 PLCXD2Q0VAA5 305 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 RAB39AQ14964 217 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 GAB4Q2WGN9 574 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 VWA2Q5GFL6 755 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM69BQ5VUD6 431 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC15A4Q8N697 577 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 ZFP41Q8N8Y5 198 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 GOLM1Q8NBJ4 401 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 SNX33Q8WV41 574 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 LRR1Q96L50 414 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 DPH1Q9BZG8 443 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 DCSTAMPQ9H295 470 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 NEK6Q9HC98 313 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 TIGARQ9NQ88 270 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 CUTCQ9NTM9 273 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 DAPP1Q9UN19 280 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 SSR3Q9UNL2 185 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms